Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB5

LIX1L, LIX1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIX1LQ8IVB5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIX1LQ8IVB5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIX1LQ8IVB5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIX1LQ8IVB5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIX1LQ8IVB5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIX1LQ8IVB5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIX1LQ8IVB5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LIX1LQ8IVB5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LIX1LQ8IVB5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LIX1LQ8IVB5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LIX1LQ8IVB5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LIX1LQ8IVB5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LIX1LQ8IVB5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LIX1LQ8IVB5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LIX1LQ8IVB5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LIX1LQ8IVB5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIX1LQ8IVB5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIX1LQ8IVB5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIX1LQ8IVB5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIX1LQ8IVB5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIX1LQ8IVB5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIX1LQ8IVB5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIX1LQ8IVB5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIX1LQ8IVB5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIX1LQ8IVB5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIX1LQ8IVB5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIX1LQ8IVB5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LIX1LQ8IVB5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIX1LQ8IVB5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIX1LQ8IVB5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIX1LQ8IVB5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIX1LQ8IVB5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIX1LQ8IVB5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIX1LQ8IVB5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIX1LQ8IVB5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIX1LQ8IVB5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIX1LQ8IVB5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIX1LQ8IVB5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIX1LQ8IVB5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIX1LQ8IVB5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIX1LQ8IVB5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIX1LQ8IVB5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIX1LQ8IVB5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIX1LQ8IVB5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIX1LQ8IVB5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIX1LQ8IVB5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIX1LQ8IVB5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIX1LQ8IVB5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIX1LQ8IVB5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIX1LQ8IVB5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIX1LQ8IVB5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIX1LQ8IVB5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIX1LQ8IVB5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIX1LQ8IVB5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIX1LQ8IVB5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LIX1LQ8IVB5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LIX1LQ8IVB5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LIX1LQ8IVB5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIX1LQ8IVB5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIX1LQ8IVB5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIX1LQ8IVB5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIX1LQ8IVB5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIX1LQ8IVB5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIX1LQ8IVB5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIX1LQ8IVB5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIX1LQ8IVB5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIX1LQ8IVB5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIX1LQ8IVB5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIX1LQ8IVB5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIX1LQ8IVB5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIX1LQ8IVB5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIX1LQ8IVB5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIX1LQ8IVB5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIX1LQ8IVB5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LIX1LQ8IVB5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIX1LQ8IVB5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms