Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV6

TMEM173, Stimulator of interferon genes protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM173Q86WV6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM173Q86WV6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM173Q86WV6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM173Q86WV6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM173Q86WV6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM173Q86WV6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM173Q86WV6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM173Q86WV6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM173Q86WV6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM173Q86WV6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM173Q86WV6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM173Q86WV6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM173Q86WV6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM173Q86WV6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM173Q86WV6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM173Q86WV6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM173Q86WV6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM173Q86WV6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM173Q86WV6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM173Q86WV6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM173Q86WV6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM173Q86WV6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM173Q86WV6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM173Q86WV6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM173Q86WV6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM173Q86WV6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM173Q86WV6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM173Q86WV6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM173Q86WV6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM173Q86WV6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM173Q86WV6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM173Q86WV6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TMEM173Q86WV6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM173Q86WV6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM173Q86WV6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM173Q86WV6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM173Q86WV6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TMEM173Q86WV6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM173Q86WV6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM173Q86WV6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM173Q86WV6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM173Q86WV6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM173Q86WV6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM173Q86WV6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM173Q86WV6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM173Q86WV6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM173Q86WV6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM173Q86WV6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TMEM173Q86WV6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM173Q86WV6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM173Q86WV6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM173Q86WV6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM173Q86WV6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM173Q86WV6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM173Q86WV6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM173Q86WV6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM173Q86WV6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM173Q86WV6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM173Q86WV6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM173Q86WV6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM173Q86WV6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM173Q86WV6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM173Q86WV6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM173Q86WV6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM173Q86WV6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM173Q86WV6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM173Q86WV6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM173Q86WV6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM173Q86WV6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM173Q86WV6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM173Q86WV6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM173Q86WV6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM173Q86WV6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM173Q86WV6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM173Q86WV6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM173Q86WV6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM173Q86WV6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMEM173Q86WV6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMEM173Q86WV6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM173Q86WV6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM173Q86WV6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM173Q86WV6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM173Q86WV6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM173Q86WV6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM173Q86WV6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM173Q86WV6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM173Q86WV6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM173Q86WV6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM173Q86WV6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM173Q86WV6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM173Q86WV6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM173Q86WV6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM173Q86WV6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM173Q86WV6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM173Q86WV6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM173Q86WV6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM173Q86WV6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM173Q86WV6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM173Q86WV6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM173Q86WV6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms