Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
YTHDF3Q7Z739 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
YTHDF3Q7Z739 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
YTHDF3Q7Z739 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
YTHDF3Q7Z739 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
YTHDF3Q7Z739 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
YTHDF3Q7Z739 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
YTHDF3Q7Z739 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
YTHDF3Q7Z739 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
YTHDF3Q7Z739 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YTHDF3Q7Z739 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
YTHDF3Q7Z739 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
YTHDF3Q7Z739 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
YTHDF3Q7Z739 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
YTHDF3Q7Z739 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
YTHDF3Q7Z739 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
YTHDF3Q7Z739 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
YTHDF3Q7Z739 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
YTHDF3Q7Z739 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
YTHDF3Q7Z739 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
YTHDF3Q7Z739 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
YTHDF3Q7Z739 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
YTHDF3Q7Z739 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
YTHDF3Q7Z739 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
YTHDF3Q7Z739 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
YTHDF3Q7Z739 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
YTHDF3Q7Z739 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YTHDF3Q7Z739 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YTHDF3Q7Z739 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YTHDF3Q7Z739 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YTHDF3Q7Z739 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YTHDF3Q7Z739 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YTHDF3Q7Z739 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
YTHDF3Q7Z739 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YTHDF3Q7Z739 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YTHDF3Q7Z739 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YTHDF3Q7Z739 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
YTHDF3Q7Z739 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
YTHDF3Q7Z739 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
YTHDF3Q7Z739 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
YTHDF3Q7Z739 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
YTHDF3Q7Z739 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
YTHDF3Q7Z739 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
YTHDF3Q7Z739 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
YTHDF3Q7Z739 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
YTHDF3Q7Z739 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
YTHDF3Q7Z739 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
YTHDF3Q7Z739 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
YTHDF3Q7Z739 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
YTHDF3Q7Z739 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
YTHDF3Q7Z739 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
YTHDF3Q7Z739 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
YTHDF3Q7Z739 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
YTHDF3Q7Z739 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
YTHDF3Q7Z739 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
YTHDF3Q7Z739 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
YTHDF3Q7Z739 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
YTHDF3Q7Z739 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
YTHDF3Q7Z739 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
YTHDF3Q7Z739 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
YTHDF3Q7Z739 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
YTHDF3Q7Z739 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
YTHDF3Q7Z739 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
YTHDF3Q7Z739 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
YTHDF3Q7Z739 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
YTHDF3Q7Z739 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
YTHDF3Q7Z739 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
YTHDF3Q7Z739 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
YTHDF3Q7Z739 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
YTHDF3Q7Z739 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
YTHDF3Q7Z739 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
YTHDF3Q7Z739 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms