Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT07

TBC1D9, TBC1 domain family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D9Q6ZT07 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TBC1D9Q6ZT07 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TBC1D9Q6ZT07 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TBC1D9Q6ZT07 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TBC1D9Q6ZT07 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TBC1D9Q6ZT07 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TBC1D9Q6ZT07 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TBC1D9Q6ZT07 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TBC1D9Q6ZT07 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TBC1D9Q6ZT07 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TBC1D9Q6ZT07 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TBC1D9Q6ZT07 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TBC1D9Q6ZT07 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TBC1D9Q6ZT07 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TBC1D9Q6ZT07 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TBC1D9Q6ZT07 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TBC1D9Q6ZT07 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
TBC1D9Q6ZT07 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TBC1D9Q6ZT07 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TBC1D9Q6ZT07 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TBC1D9Q6ZT07 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TBC1D9Q6ZT07 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
TBC1D9Q6ZT07 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TBC1D9Q6ZT07 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TBC1D9Q6ZT07 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TBC1D9Q6ZT07 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TBC1D9Q6ZT07 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TBC1D9Q6ZT07 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TBC1D9Q6ZT07 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TBC1D9Q6ZT07 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TBC1D9Q6ZT07 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TBC1D9Q6ZT07 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TBC1D9Q6ZT07 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
TBC1D9Q6ZT07 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TBC1D9Q6ZT07 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TBC1D9Q6ZT07 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
TBC1D9Q6ZT07 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TBC1D9Q6ZT07 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TBC1D9Q6ZT07 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TBC1D9Q6ZT07 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TBC1D9Q6ZT07 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TBC1D9Q6ZT07 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TBC1D9Q6ZT07 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
TBC1D9Q6ZT07 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
TBC1D9Q6ZT07 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
TBC1D9Q6ZT07 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
TBC1D9Q6ZT07 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TBC1D9Q6ZT07 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TBC1D9Q6ZT07 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TBC1D9Q6ZT07 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TBC1D9Q6ZT07 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TBC1D9Q6ZT07 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TBC1D9Q6ZT07 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TBC1D9Q6ZT07 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TBC1D9Q6ZT07 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TBC1D9Q6ZT07 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TBC1D9Q6ZT07 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TBC1D9Q6ZT07 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TBC1D9Q6ZT07 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TBC1D9Q6ZT07 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TBC1D9Q6ZT07 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TBC1D9Q6ZT07 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TBC1D9Q6ZT07 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TBC1D9Q6ZT07 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TBC1D9Q6ZT07 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
TBC1D9Q6ZT07 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TBC1D9Q6ZT07 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TBC1D9Q6ZT07 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
TBC1D9Q6ZT07 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
TBC1D9Q6ZT07 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TBC1D9Q6ZT07 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TBC1D9Q6ZT07 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TBC1D9Q6ZT07 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TBC1D9Q6ZT07 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TBC1D9Q6ZT07 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TBC1D9Q6ZT07 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TBC1D9Q6ZT07 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TBC1D9Q6ZT07 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TBC1D9Q6ZT07 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TBC1D9Q6ZT07 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TBC1D9Q6ZT07 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TBC1D9Q6ZT07 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TBC1D9Q6ZT07 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TBC1D9Q6ZT07 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TBC1D9Q6ZT07 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TBC1D9Q6ZT07 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TBC1D9Q6ZT07 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TBC1D9Q6ZT07 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TBC1D9Q6ZT07 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
TBC1D9Q6ZT07 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TBC1D9Q6ZT07 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TBC1D9Q6ZT07 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TBC1D9Q6ZT07 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TBC1D9Q6ZT07 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TBC1D9Q6ZT07 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TBC1D9Q6ZT07 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TBC1D9Q6ZT07 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TBC1D9Q6ZT07 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
TBC1D9Q6ZT07 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.64
TBC1D9Q6ZT07 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 755 ms