Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCD3Q6STE5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCD3Q6STE5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCD3Q6STE5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCD3Q6STE5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCD3Q6STE5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCD3Q6STE5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCD3Q6STE5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCD3Q6STE5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCD3Q6STE5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCD3Q6STE5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCD3Q6STE5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCD3Q6STE5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCD3Q6STE5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCD3Q6STE5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCD3Q6STE5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCD3Q6STE5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCD3Q6STE5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCD3Q6STE5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCD3Q6STE5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCD3Q6STE5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCD3Q6STE5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCD3Q6STE5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCD3Q6STE5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCD3Q6STE5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCD3Q6STE5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCD3Q6STE5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCD3Q6STE5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCD3Q6STE5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCD3Q6STE5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCD3Q6STE5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCD3Q6STE5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCD3Q6STE5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCD3Q6STE5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCD3Q6STE5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCD3Q6STE5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCD3Q6STE5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCD3Q6STE5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMARCD3Q6STE5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCD3Q6STE5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCD3Q6STE5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD3Q6STE5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD3Q6STE5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD3Q6STE5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD3Q6STE5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCD3Q6STE5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCD3Q6STE5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCD3Q6STE5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCD3Q6STE5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCD3Q6STE5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCD3Q6STE5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCD3Q6STE5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCD3Q6STE5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD3Q6STE5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD3Q6STE5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD3Q6STE5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD3Q6STE5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD3Q6STE5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD3Q6STE5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCD3Q6STE5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCD3Q6STE5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCD3Q6STE5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCD3Q6STE5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCD3Q6STE5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCD3Q6STE5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCD3Q6STE5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCD3Q6STE5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCD3Q6STE5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCD3Q6STE5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCD3Q6STE5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMARCD3Q6STE5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMARCD3Q6STE5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMARCD3Q6STE5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCD3Q6STE5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCD3Q6STE5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCD3Q6STE5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCD3Q6STE5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCD3Q6STE5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCD3Q6STE5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCD3Q6STE5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCD3Q6STE5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCD3Q6STE5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCD3Q6STE5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCD3Q6STE5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCD3Q6STE5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCD3Q6STE5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCD3Q6STE5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCD3Q6STE5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCD3Q6STE5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCD3Q6STE5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCD3Q6STE5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCD3Q6STE5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCD3Q6STE5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCD3Q6STE5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCD3Q6STE5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCD3Q6STE5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCD3Q6STE5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCD3Q6STE5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCD3Q6STE5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCD3Q6STE5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms