Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBA3EQ6PEY2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBA3EQ6PEY2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TUBA3EQ6PEY2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBA3EQ6PEY2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBA3EQ6PEY2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBA3EQ6PEY2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBA3EQ6PEY2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBA3EQ6PEY2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBA3EQ6PEY2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBA3EQ6PEY2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBA3EQ6PEY2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBA3EQ6PEY2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBA3EQ6PEY2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBA3EQ6PEY2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBA3EQ6PEY2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBA3EQ6PEY2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBA3EQ6PEY2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBA3EQ6PEY2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBA3EQ6PEY2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBA3EQ6PEY2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBA3EQ6PEY2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBA3EQ6PEY2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBA3EQ6PEY2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBA3EQ6PEY2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBA3EQ6PEY2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBA3EQ6PEY2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBA3EQ6PEY2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBA3EQ6PEY2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBA3EQ6PEY2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBA3EQ6PEY2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBA3EQ6PEY2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBA3EQ6PEY2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBA3EQ6PEY2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBA3EQ6PEY2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TUBA3EQ6PEY2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBA3EQ6PEY2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBA3EQ6PEY2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBA3EQ6PEY2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBA3EQ6PEY2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBA3EQ6PEY2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBA3EQ6PEY2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBA3EQ6PEY2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBA3EQ6PEY2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBA3EQ6PEY2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBA3EQ6PEY2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBA3EQ6PEY2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBA3EQ6PEY2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBA3EQ6PEY2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBA3EQ6PEY2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBA3EQ6PEY2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBA3EQ6PEY2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA3EQ6PEY2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA3EQ6PEY2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA3EQ6PEY2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA3EQ6PEY2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA3EQ6PEY2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA3EQ6PEY2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA3EQ6PEY2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA3EQ6PEY2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA3EQ6PEY2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA3EQ6PEY2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA3EQ6PEY2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA3EQ6PEY2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms