Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPBLQ6KC79 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.535e-6■■■■■ 32.2
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NIPBLQ6KC79 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.155e-6■■■■■ 32.2
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NIPBLQ6KC79 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.165e-6■■■■■ 32.2
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NIPBLQ6KC79 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.485e-6■■■■■ 32.2
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NIPBLQ6KC79 SLC38A1-202ENST00000439706 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.935e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 SLC38A1-206ENST00000549049 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.955e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.985e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 UTP14A-201ENST00000394422 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.995e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 SPIDR-206ENST00000518074 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.995e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 SCLY-215ENST00000480357 5668 ntTSL 1 (best)8.68□□□□□ -1.025e-6■■■■■ 32.2
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NIPBLQ6KC79 PSMD2-217ENST00000491149 895 ntTSL 28.66□□□□□ -1.025e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.045e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 RAI14-206ENST00000504052 630 ntTSL 48.53□□□□□ -1.045e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 SLC38A1-210ENST00000552197 2599 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.065e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.075e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 UTP14A-202ENST00000425117 2403 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.075e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 USP39-210ENST00000459775 2148 ntTSL 28.29□□□□□ -1.085e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 KCNAB2-204ENST00000378083 4142 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.095e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 KCNAB2-201ENST00000164247 4273 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.15e-6■■■■■ 32.2
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NIPBLQ6KC79 RAI14-203ENST00000502736 569 ntTSL 48.08□□□□□ -1.125e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 SPIDR-211ENST00000519401 2090 ntTSL 28.08□□□□□ -1.125e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 GTPBP10-207ENST00000439832 545 ntTSL 28□□□□□ -1.135e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 GTPBP10-209ENST00000453512 636 ntTSL 57.98□□□□□ -1.135e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 GTPBP10-205ENST00000421719 686 ntTSL 57.98□□□□□ -1.135e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 SPIDR-217ENST00000522117 2745 ntTSL 27.97□□□□□ -1.135e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 API5-201ENST00000378852 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.145e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 SEC61A1-205ENST00000483956 3046 ntTSL 1 (best)7.84□□□□□ -1.155e-6■■■■■ 32.2
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