Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SDE2Q6IQ49 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SDE2Q6IQ49 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SDE2Q6IQ49 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SDE2Q6IQ49 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SDE2Q6IQ49 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SDE2Q6IQ49 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SDE2Q6IQ49 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDE2Q6IQ49 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDE2Q6IQ49 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDE2Q6IQ49 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDE2Q6IQ49 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDE2Q6IQ49 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDE2Q6IQ49 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SDE2Q6IQ49 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDE2Q6IQ49 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDE2Q6IQ49 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDE2Q6IQ49 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDE2Q6IQ49 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDE2Q6IQ49 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDE2Q6IQ49 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDE2Q6IQ49 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDE2Q6IQ49 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDE2Q6IQ49 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDE2Q6IQ49 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SDE2Q6IQ49 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SDE2Q6IQ49 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SDE2Q6IQ49 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SDE2Q6IQ49 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SDE2Q6IQ49 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDE2Q6IQ49 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDE2Q6IQ49 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDE2Q6IQ49 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDE2Q6IQ49 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SDE2Q6IQ49 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SDE2Q6IQ49 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SDE2Q6IQ49 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SDE2Q6IQ49 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SDE2Q6IQ49 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDE2Q6IQ49 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDE2Q6IQ49 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDE2Q6IQ49 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDE2Q6IQ49 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDE2Q6IQ49 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDE2Q6IQ49 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDE2Q6IQ49 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDE2Q6IQ49 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDE2Q6IQ49 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDE2Q6IQ49 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDE2Q6IQ49 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SDE2Q6IQ49 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDE2Q6IQ49 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SDE2Q6IQ49 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SDE2Q6IQ49 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SDE2Q6IQ49 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDE2Q6IQ49 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDE2Q6IQ49 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDE2Q6IQ49 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDE2Q6IQ49 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDE2Q6IQ49 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDE2Q6IQ49 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDE2Q6IQ49 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDE2Q6IQ49 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDE2Q6IQ49 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDE2Q6IQ49 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDE2Q6IQ49 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDE2Q6IQ49 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDE2Q6IQ49 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDE2Q6IQ49 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDE2Q6IQ49 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SDE2Q6IQ49 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SDE2Q6IQ49 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SDE2Q6IQ49 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SDE2Q6IQ49 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SDE2Q6IQ49 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SDE2Q6IQ49 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SDE2Q6IQ49 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SDE2Q6IQ49 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SDE2Q6IQ49 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SDE2Q6IQ49 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SDE2Q6IQ49 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SDE2Q6IQ49 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SDE2Q6IQ49 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SDE2Q6IQ49 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SDE2Q6IQ49 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SDE2Q6IQ49 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SDE2Q6IQ49 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SDE2Q6IQ49 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SDE2Q6IQ49 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SDE2Q6IQ49 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SDE2Q6IQ49 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDE2Q6IQ49 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDE2Q6IQ49 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDE2Q6IQ49 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SDE2Q6IQ49 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SDE2Q6IQ49 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SDE2Q6IQ49 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SDE2Q6IQ49 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SDE2Q6IQ49 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SDE2Q6IQ49 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.3 ms