Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCARA3Q6AZY7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCARA3Q6AZY7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCARA3Q6AZY7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCARA3Q6AZY7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCARA3Q6AZY7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SCARA3Q6AZY7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SCARA3Q6AZY7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SCARA3Q6AZY7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCARA3Q6AZY7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCARA3Q6AZY7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SCARA3Q6AZY7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCARA3Q6AZY7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCARA3Q6AZY7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCARA3Q6AZY7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCARA3Q6AZY7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCARA3Q6AZY7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCARA3Q6AZY7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCARA3Q6AZY7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCARA3Q6AZY7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCARA3Q6AZY7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCARA3Q6AZY7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCARA3Q6AZY7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCARA3Q6AZY7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCARA3Q6AZY7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SCARA3Q6AZY7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCARA3Q6AZY7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCARA3Q6AZY7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCARA3Q6AZY7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCARA3Q6AZY7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SCARA3Q6AZY7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SCARA3Q6AZY7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SCARA3Q6AZY7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCARA3Q6AZY7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCARA3Q6AZY7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCARA3Q6AZY7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCARA3Q6AZY7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SCARA3Q6AZY7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCARA3Q6AZY7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCARA3Q6AZY7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCARA3Q6AZY7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCARA3Q6AZY7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCARA3Q6AZY7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCARA3Q6AZY7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCARA3Q6AZY7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCARA3Q6AZY7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCARA3Q6AZY7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCARA3Q6AZY7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCARA3Q6AZY7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SCARA3Q6AZY7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCARA3Q6AZY7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCARA3Q6AZY7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCARA3Q6AZY7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCARA3Q6AZY7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCARA3Q6AZY7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SCARA3Q6AZY7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCARA3Q6AZY7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCARA3Q6AZY7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCARA3Q6AZY7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCARA3Q6AZY7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCARA3Q6AZY7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCARA3Q6AZY7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCARA3Q6AZY7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms