Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP2LQ5T4T6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP2LQ5T4T6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP2LQ5T4T6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCP2LQ5T4T6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYCP2LQ5T4T6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYCP2LQ5T4T6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYCP2LQ5T4T6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYCP2LQ5T4T6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYCP2LQ5T4T6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYCP2LQ5T4T6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCP2LQ5T4T6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCP2LQ5T4T6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCP2LQ5T4T6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCP2LQ5T4T6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCP2LQ5T4T6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCP2LQ5T4T6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCP2LQ5T4T6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCP2LQ5T4T6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCP2LQ5T4T6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCP2LQ5T4T6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCP2LQ5T4T6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCP2LQ5T4T6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCP2LQ5T4T6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCP2LQ5T4T6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP2LQ5T4T6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCP2LQ5T4T6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP2LQ5T4T6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP2LQ5T4T6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP2LQ5T4T6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP2LQ5T4T6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP2LQ5T4T6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP2LQ5T4T6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCP2LQ5T4T6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP2LQ5T4T6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP2LQ5T4T6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCP2LQ5T4T6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP2LQ5T4T6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP2LQ5T4T6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCP2LQ5T4T6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCP2LQ5T4T6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCP2LQ5T4T6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCP2LQ5T4T6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCP2LQ5T4T6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP2LQ5T4T6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP2LQ5T4T6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP2LQ5T4T6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP2LQ5T4T6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCP2LQ5T4T6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCP2LQ5T4T6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCP2LQ5T4T6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCP2LQ5T4T6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCP2LQ5T4T6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCP2LQ5T4T6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCP2LQ5T4T6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCP2LQ5T4T6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SYCP2LQ5T4T6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYCP2LQ5T4T6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYCP2LQ5T4T6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYCP2LQ5T4T6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SYCP2LQ5T4T6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYCP2LQ5T4T6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCP2LQ5T4T6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCP2LQ5T4T6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCP2LQ5T4T6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCP2LQ5T4T6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCP2LQ5T4T6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCP2LQ5T4T6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCP2LQ5T4T6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP2LQ5T4T6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP2LQ5T4T6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP2LQ5T4T6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP2LQ5T4T6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP2LQ5T4T6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP2LQ5T4T6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP2LQ5T4T6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP2LQ5T4T6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP2LQ5T4T6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCP2LQ5T4T6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCP2LQ5T4T6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCP2LQ5T4T6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCP2LQ5T4T6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYCP2LQ5T4T6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP2LQ5T4T6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP2LQ5T4T6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP2LQ5T4T6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP2LQ5T4T6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCP2LQ5T4T6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCP2LQ5T4T6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCP2LQ5T4T6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCP2LQ5T4T6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCP2LQ5T4T6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCP2LQ5T4T6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP2LQ5T4T6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP2LQ5T4T6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCP2LQ5T4T6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCP2LQ5T4T6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCP2LQ5T4T6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCP2LQ5T4T6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYCP2LQ5T4T6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms