Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZFYVE27Q5T4F4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZFYVE27Q5T4F4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZFYVE27Q5T4F4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZFYVE27Q5T4F4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZFYVE27Q5T4F4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZFYVE27Q5T4F4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZFYVE27Q5T4F4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZFYVE27Q5T4F4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZFYVE27Q5T4F4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZFYVE27Q5T4F4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZFYVE27Q5T4F4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZFYVE27Q5T4F4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ZFYVE27Q5T4F4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZFYVE27Q5T4F4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZFYVE27Q5T4F4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZFYVE27Q5T4F4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZFYVE27Q5T4F4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZFYVE27Q5T4F4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZFYVE27Q5T4F4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZFYVE27Q5T4F4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZFYVE27Q5T4F4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZFYVE27Q5T4F4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZFYVE27Q5T4F4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZFYVE27Q5T4F4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZFYVE27Q5T4F4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZFYVE27Q5T4F4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ZFYVE27Q5T4F4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZFYVE27Q5T4F4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZFYVE27Q5T4F4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZFYVE27Q5T4F4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZFYVE27Q5T4F4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ZFYVE27Q5T4F4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZFYVE27Q5T4F4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZFYVE27Q5T4F4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ZFYVE27Q5T4F4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZFYVE27Q5T4F4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZFYVE27Q5T4F4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZFYVE27Q5T4F4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZFYVE27Q5T4F4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZFYVE27Q5T4F4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZFYVE27Q5T4F4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZFYVE27Q5T4F4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZFYVE27Q5T4F4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZFYVE27Q5T4F4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZFYVE27Q5T4F4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZFYVE27Q5T4F4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZFYVE27Q5T4F4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZFYVE27Q5T4F4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZFYVE27Q5T4F4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZFYVE27Q5T4F4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZFYVE27Q5T4F4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZFYVE27Q5T4F4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZFYVE27Q5T4F4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZFYVE27Q5T4F4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZFYVE27Q5T4F4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZFYVE27Q5T4F4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZFYVE27Q5T4F4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZFYVE27Q5T4F4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ZFYVE27Q5T4F4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZFYVE27Q5T4F4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
ZFYVE27Q5T4F4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZFYVE27Q5T4F4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZFYVE27Q5T4F4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZFYVE27Q5T4F4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ZFYVE27Q5T4F4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZFYVE27Q5T4F4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZFYVE27Q5T4F4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZFYVE27Q5T4F4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZFYVE27Q5T4F4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZFYVE27Q5T4F4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZFYVE27Q5T4F4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZFYVE27Q5T4F4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZFYVE27Q5T4F4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZFYVE27Q5T4F4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZFYVE27Q5T4F4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZFYVE27Q5T4F4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZFYVE27Q5T4F4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZFYVE27Q5T4F4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZFYVE27Q5T4F4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZFYVE27Q5T4F4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZFYVE27Q5T4F4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZFYVE27Q5T4F4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZFYVE27Q5T4F4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZFYVE27Q5T4F4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZFYVE27Q5T4F4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZFYVE27Q5T4F4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZFYVE27Q5T4F4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZFYVE27Q5T4F4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZFYVE27Q5T4F4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZFYVE27Q5T4F4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZFYVE27Q5T4F4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZFYVE27Q5T4F4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZFYVE27Q5T4F4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZFYVE27Q5T4F4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZFYVE27Q5T4F4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZFYVE27Q5T4F4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZFYVE27Q5T4F4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZFYVE27Q5T4F4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZFYVE27Q5T4F4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms