Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC122Q5T0U0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC122Q5T0U0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC122Q5T0U0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC122Q5T0U0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC122Q5T0U0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC122Q5T0U0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC122Q5T0U0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC122Q5T0U0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC122Q5T0U0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC122Q5T0U0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC122Q5T0U0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC122Q5T0U0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC122Q5T0U0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC122Q5T0U0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC122Q5T0U0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC122Q5T0U0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC122Q5T0U0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC122Q5T0U0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC122Q5T0U0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC122Q5T0U0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC122Q5T0U0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC122Q5T0U0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC122Q5T0U0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC122Q5T0U0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC122Q5T0U0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC122Q5T0U0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC122Q5T0U0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC122Q5T0U0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC122Q5T0U0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC122Q5T0U0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC122Q5T0U0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC122Q5T0U0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC122Q5T0U0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC122Q5T0U0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC122Q5T0U0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC122Q5T0U0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC122Q5T0U0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC122Q5T0U0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC122Q5T0U0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC122Q5T0U0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC122Q5T0U0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC122Q5T0U0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC122Q5T0U0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC122Q5T0U0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC122Q5T0U0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC122Q5T0U0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC122Q5T0U0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC122Q5T0U0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC122Q5T0U0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC122Q5T0U0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC122Q5T0U0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC122Q5T0U0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC122Q5T0U0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC122Q5T0U0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC122Q5T0U0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC122Q5T0U0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC122Q5T0U0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC122Q5T0U0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC122Q5T0U0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC122Q5T0U0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC122Q5T0U0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC122Q5T0U0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC122Q5T0U0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC122Q5T0U0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC122Q5T0U0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC122Q5T0U0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC122Q5T0U0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC122Q5T0U0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC122Q5T0U0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC122Q5T0U0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC122Q5T0U0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC122Q5T0U0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC122Q5T0U0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC122Q5T0U0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC122Q5T0U0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC122Q5T0U0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC122Q5T0U0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC122Q5T0U0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC122Q5T0U0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC122Q5T0U0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC122Q5T0U0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC122Q5T0U0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC122Q5T0U0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC122Q5T0U0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC122Q5T0U0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC122Q5T0U0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC122Q5T0U0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC122Q5T0U0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC122Q5T0U0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC122Q5T0U0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC122Q5T0U0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC122Q5T0U0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC122Q5T0U0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC122Q5T0U0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC122Q5T0U0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC122Q5T0U0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC122Q5T0U0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC122Q5T0U0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC122Q5T0U0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms