Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HP1BP3Q5SSJ5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HP1BP3Q5SSJ5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HP1BP3Q5SSJ5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HP1BP3Q5SSJ5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HP1BP3Q5SSJ5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HP1BP3Q5SSJ5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HP1BP3Q5SSJ5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HP1BP3Q5SSJ5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HP1BP3Q5SSJ5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HP1BP3Q5SSJ5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HP1BP3Q5SSJ5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HP1BP3Q5SSJ5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HP1BP3Q5SSJ5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HP1BP3Q5SSJ5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HP1BP3Q5SSJ5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HP1BP3Q5SSJ5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HP1BP3Q5SSJ5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HP1BP3Q5SSJ5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HP1BP3Q5SSJ5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HP1BP3Q5SSJ5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HP1BP3Q5SSJ5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HP1BP3Q5SSJ5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HP1BP3Q5SSJ5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HP1BP3Q5SSJ5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HP1BP3Q5SSJ5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HP1BP3Q5SSJ5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HP1BP3Q5SSJ5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HP1BP3Q5SSJ5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HP1BP3Q5SSJ5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HP1BP3Q5SSJ5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HP1BP3Q5SSJ5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HP1BP3Q5SSJ5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HP1BP3Q5SSJ5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HP1BP3Q5SSJ5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HP1BP3Q5SSJ5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HP1BP3Q5SSJ5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HP1BP3Q5SSJ5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HP1BP3Q5SSJ5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HP1BP3Q5SSJ5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HP1BP3Q5SSJ5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HP1BP3Q5SSJ5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HP1BP3Q5SSJ5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HP1BP3Q5SSJ5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HP1BP3Q5SSJ5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HP1BP3Q5SSJ5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HP1BP3Q5SSJ5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HP1BP3Q5SSJ5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HP1BP3Q5SSJ5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HP1BP3Q5SSJ5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HP1BP3Q5SSJ5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HP1BP3Q5SSJ5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HP1BP3Q5SSJ5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HP1BP3Q5SSJ5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HP1BP3Q5SSJ5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HP1BP3Q5SSJ5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HP1BP3Q5SSJ5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HP1BP3Q5SSJ5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HP1BP3Q5SSJ5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HP1BP3Q5SSJ5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HP1BP3Q5SSJ5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HP1BP3Q5SSJ5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HP1BP3Q5SSJ5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HP1BP3Q5SSJ5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HP1BP3Q5SSJ5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HP1BP3Q5SSJ5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HP1BP3Q5SSJ5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HP1BP3Q5SSJ5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HP1BP3Q5SSJ5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HP1BP3Q5SSJ5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HP1BP3Q5SSJ5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HP1BP3Q5SSJ5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HP1BP3Q5SSJ5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HP1BP3Q5SSJ5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HP1BP3Q5SSJ5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HP1BP3Q5SSJ5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HP1BP3Q5SSJ5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HP1BP3Q5SSJ5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HP1BP3Q5SSJ5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HP1BP3Q5SSJ5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HP1BP3Q5SSJ5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HP1BP3Q5SSJ5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HP1BP3Q5SSJ5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HP1BP3Q5SSJ5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HP1BP3Q5SSJ5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HP1BP3Q5SSJ5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HP1BP3Q5SSJ5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HP1BP3Q5SSJ5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HP1BP3Q5SSJ5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HP1BP3Q5SSJ5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HP1BP3Q5SSJ5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HP1BP3Q5SSJ5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HP1BP3Q5SSJ5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HP1BP3Q5SSJ5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HP1BP3Q5SSJ5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HP1BP3Q5SSJ5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms