Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTN6

WDR38, WD repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR38Q5JTN6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR38Q5JTN6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WDR38Q5JTN6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR38Q5JTN6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR38Q5JTN6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WDR38Q5JTN6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR38Q5JTN6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR38Q5JTN6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR38Q5JTN6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WDR38Q5JTN6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR38Q5JTN6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR38Q5JTN6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR38Q5JTN6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR38Q5JTN6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR38Q5JTN6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR38Q5JTN6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR38Q5JTN6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR38Q5JTN6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR38Q5JTN6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR38Q5JTN6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR38Q5JTN6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR38Q5JTN6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR38Q5JTN6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR38Q5JTN6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR38Q5JTN6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR38Q5JTN6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR38Q5JTN6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR38Q5JTN6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR38Q5JTN6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR38Q5JTN6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR38Q5JTN6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR38Q5JTN6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR38Q5JTN6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR38Q5JTN6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR38Q5JTN6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR38Q5JTN6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR38Q5JTN6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR38Q5JTN6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR38Q5JTN6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR38Q5JTN6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR38Q5JTN6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR38Q5JTN6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR38Q5JTN6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR38Q5JTN6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR38Q5JTN6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR38Q5JTN6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR38Q5JTN6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR38Q5JTN6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR38Q5JTN6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR38Q5JTN6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR38Q5JTN6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR38Q5JTN6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR38Q5JTN6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR38Q5JTN6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR38Q5JTN6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR38Q5JTN6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR38Q5JTN6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR38Q5JTN6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR38Q5JTN6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR38Q5JTN6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR38Q5JTN6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR38Q5JTN6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR38Q5JTN6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR38Q5JTN6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR38Q5JTN6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR38Q5JTN6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR38Q5JTN6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR38Q5JTN6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR38Q5JTN6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR38Q5JTN6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR38Q5JTN6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR38Q5JTN6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
WDR38Q5JTN6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR38Q5JTN6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR38Q5JTN6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR38Q5JTN6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR38Q5JTN6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR38Q5JTN6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR38Q5JTN6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR38Q5JTN6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR38Q5JTN6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR38Q5JTN6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR38Q5JTN6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR38Q5JTN6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR38Q5JTN6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR38Q5JTN6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR38Q5JTN6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR38Q5JTN6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR38Q5JTN6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR38Q5JTN6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR38Q5JTN6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR38Q5JTN6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR38Q5JTN6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR38Q5JTN6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR38Q5JTN6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR38Q5JTN6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR38Q5JTN6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR38Q5JTN6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR38Q5JTN6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR38Q5JTN6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms