Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHB4

SLC5A12, Sodium-coupled monocarboxylate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A12Q1EHB4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A12Q1EHB4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A12Q1EHB4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A12Q1EHB4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A12Q1EHB4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A12Q1EHB4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A12Q1EHB4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A12Q1EHB4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A12Q1EHB4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A12Q1EHB4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A12Q1EHB4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A12Q1EHB4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC5A12Q1EHB4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC5A12Q1EHB4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC5A12Q1EHB4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC5A12Q1EHB4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A12Q1EHB4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A12Q1EHB4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A12Q1EHB4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A12Q1EHB4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A12Q1EHB4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A12Q1EHB4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A12Q1EHB4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A12Q1EHB4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A12Q1EHB4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A12Q1EHB4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A12Q1EHB4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A12Q1EHB4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A12Q1EHB4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A12Q1EHB4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A12Q1EHB4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A12Q1EHB4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A12Q1EHB4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A12Q1EHB4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A12Q1EHB4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A12Q1EHB4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A12Q1EHB4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A12Q1EHB4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A12Q1EHB4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A12Q1EHB4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A12Q1EHB4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A12Q1EHB4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A12Q1EHB4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A12Q1EHB4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A12Q1EHB4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A12Q1EHB4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A12Q1EHB4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A12Q1EHB4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A12Q1EHB4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A12Q1EHB4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A12Q1EHB4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A12Q1EHB4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A12Q1EHB4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A12Q1EHB4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A12Q1EHB4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A12Q1EHB4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A12Q1EHB4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A12Q1EHB4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A12Q1EHB4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A12Q1EHB4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A12Q1EHB4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A12Q1EHB4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A12Q1EHB4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC5A12Q1EHB4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A12Q1EHB4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A12Q1EHB4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A12Q1EHB4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A12Q1EHB4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A12Q1EHB4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A12Q1EHB4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC5A12Q1EHB4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC5A12Q1EHB4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC5A12Q1EHB4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC5A12Q1EHB4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC5A12Q1EHB4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A12Q1EHB4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A12Q1EHB4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A12Q1EHB4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A12Q1EHB4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A12Q1EHB4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A12Q1EHB4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A12Q1EHB4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A12Q1EHB4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC5A12Q1EHB4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC5A12Q1EHB4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC5A12Q1EHB4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC5A12Q1EHB4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A12Q1EHB4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A12Q1EHB4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A12Q1EHB4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A12Q1EHB4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A12Q1EHB4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A12Q1EHB4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A12Q1EHB4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A12Q1EHB4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC5A12Q1EHB4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC5A12Q1EHB4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC5A12Q1EHB4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A12Q1EHB4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A12Q1EHB4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms