Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF239Q16600 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF239Q16600 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF239Q16600 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF239Q16600 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF239Q16600 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF239Q16600 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF239Q16600 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF239Q16600 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF239Q16600 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF239Q16600 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF239Q16600 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF239Q16600 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF239Q16600 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF239Q16600 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF239Q16600 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF239Q16600 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF239Q16600 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF239Q16600 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF239Q16600 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF239Q16600 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF239Q16600 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF239Q16600 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF239Q16600 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF239Q16600 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF239Q16600 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF239Q16600 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF239Q16600 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF239Q16600 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF239Q16600 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF239Q16600 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF239Q16600 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF239Q16600 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF239Q16600 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF239Q16600 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF239Q16600 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF239Q16600 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF239Q16600 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF239Q16600 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF239Q16600 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF239Q16600 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF239Q16600 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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