Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GRIK5Q16478 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIK5Q16478 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIK5Q16478 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GRIK5Q16478 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GRIK5Q16478 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GRIK5Q16478 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GRIK5Q16478 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
GRIK5Q16478 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
GRIK5Q16478 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIK5Q16478 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GRIK5Q16478 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GRIK5Q16478 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GRIK5Q16478 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIK5Q16478 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIK5Q16478 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIK5Q16478 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIK5Q16478 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GRIK5Q16478 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GRIK5Q16478 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIK5Q16478 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIK5Q16478 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIK5Q16478 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIK5Q16478 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIK5Q16478 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GRIK5Q16478 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
GRIK5Q16478 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GRIK5Q16478 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GRIK5Q16478 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GRIK5Q16478 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GRIK5Q16478 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GRIK5Q16478 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIK5Q16478 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIK5Q16478 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIK5Q16478 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIK5Q16478 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIK5Q16478 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
GRIK5Q16478 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GRIK5Q16478 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms