Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
VPS72Q15906 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
VPS72Q15906 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
VPS72Q15906 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
VPS72Q15906 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
VPS72Q15906 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
VPS72Q15906 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
VPS72Q15906 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
VPS72Q15906 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
VPS72Q15906 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
VPS72Q15906 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
VPS72Q15906 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
VPS72Q15906 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
VPS72Q15906 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
VPS72Q15906 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
VPS72Q15906 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
VPS72Q15906 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
VPS72Q15906 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
VPS72Q15906 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
VPS72Q15906 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
VPS72Q15906 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
VPS72Q15906 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
VPS72Q15906 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
VPS72Q15906 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
VPS72Q15906 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
VPS72Q15906 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
VPS72Q15906 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
VPS72Q15906 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
VPS72Q15906 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
VPS72Q15906 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
VPS72Q15906 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
VPS72Q15906 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
VPS72Q15906 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
VPS72Q15906 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
VPS72Q15906 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
VPS72Q15906 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
VPS72Q15906 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
VPS72Q15906 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
VPS72Q15906 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
VPS72Q15906 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
VPS72Q15906 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
VPS72Q15906 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
VPS72Q15906 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
VPS72Q15906 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
VPS72Q15906 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
VPS72Q15906 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
VPS72Q15906 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
VPS72Q15906 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
VPS72Q15906 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
VPS72Q15906 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
VPS72Q15906 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
VPS72Q15906 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
VPS72Q15906 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
VPS72Q15906 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
VPS72Q15906 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
VPS72Q15906 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
VPS72Q15906 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
VPS72Q15906 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.58■■■■□ 3.13
VPS72Q15906 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
VPS72Q15906 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
VPS72Q15906 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
VPS72Q15906 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
VPS72Q15906 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
VPS72Q15906 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
VPS72Q15906 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
VPS72Q15906 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
VPS72Q15906 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
VPS72Q15906 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
VPS72Q15906 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
VPS72Q15906 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
VPS72Q15906 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
VPS72Q15906 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
VPS72Q15906 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
VPS72Q15906 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
VPS72Q15906 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
VPS72Q15906 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
VPS72Q15906 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
VPS72Q15906 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
VPS72Q15906 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
VPS72Q15906 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
VPS72Q15906 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
VPS72Q15906 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
VPS72Q15906 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
VPS72Q15906 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
VPS72Q15906 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
VPS72Q15906 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
VPS72Q15906 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
VPS72Q15906 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
VPS72Q15906 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
VPS72Q15906 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
VPS72Q15906 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
VPS72Q15906 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
VPS72Q15906 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
VPS72Q15906 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
VPS72Q15906 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
VPS72Q15906 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
VPS72Q15906 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
VPS72Q15906 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
VPS72Q15906 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
VPS72Q15906 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms