Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPTX1Q15818 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPTX1Q15818 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPTX1Q15818 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NPTX1Q15818 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPTX1Q15818 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPTX1Q15818 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPTX1Q15818 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPTX1Q15818 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPTX1Q15818 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPTX1Q15818 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPTX1Q15818 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPTX1Q15818 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPTX1Q15818 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPTX1Q15818 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPTX1Q15818 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPTX1Q15818 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPTX1Q15818 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPTX1Q15818 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPTX1Q15818 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPTX1Q15818 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPTX1Q15818 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPTX1Q15818 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPTX1Q15818 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPTX1Q15818 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPTX1Q15818 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NPTX1Q15818 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPTX1Q15818 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPTX1Q15818 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPTX1Q15818 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPTX1Q15818 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPTX1Q15818 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPTX1Q15818 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPTX1Q15818 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPTX1Q15818 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPTX1Q15818 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPTX1Q15818 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPTX1Q15818 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPTX1Q15818 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPTX1Q15818 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPTX1Q15818 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPTX1Q15818 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTX1Q15818 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTX1Q15818 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTX1Q15818 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTX1Q15818 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTX1Q15818 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTX1Q15818 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTX1Q15818 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTX1Q15818 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTX1Q15818 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPTX1Q15818 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPTX1Q15818 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPTX1Q15818 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTX1Q15818 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTX1Q15818 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTX1Q15818 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTX1Q15818 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTX1Q15818 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTX1Q15818 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTX1Q15818 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTX1Q15818 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTX1Q15818 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTX1Q15818 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTX1Q15818 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTX1Q15818 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTX1Q15818 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NPTX1Q15818 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPTX1Q15818 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPTX1Q15818 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPTX1Q15818 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPTX1Q15818 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPTX1Q15818 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPTX1Q15818 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPTX1Q15818 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPTX1Q15818 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPTX1Q15818 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPTX1Q15818 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPTX1Q15818 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPTX1Q15818 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPTX1Q15818 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPTX1Q15818 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPTX1Q15818 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPTX1Q15818 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPTX1Q15818 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPTX1Q15818 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPTX1Q15818 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPTX1Q15818 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPTX1Q15818 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPTX1Q15818 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPTX1Q15818 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPTX1Q15818 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPTX1Q15818 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPTX1Q15818 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPTX1Q15818 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPTX1Q15818 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPTX1Q15818 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPTX1Q15818 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPTX1Q15818 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPTX1Q15818 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms