Protein–RNA interactions for Protein: Q15323

KRT31, Keratin, type I cuticular Ha1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT31Q15323 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT31Q15323 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT31Q15323 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT31Q15323 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT31Q15323 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT31Q15323 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT31Q15323 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT31Q15323 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KRT31Q15323 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KRT31Q15323 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT31Q15323 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT31Q15323 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT31Q15323 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT31Q15323 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT31Q15323 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT31Q15323 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT31Q15323 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT31Q15323 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT31Q15323 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT31Q15323 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT31Q15323 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT31Q15323 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT31Q15323 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT31Q15323 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT31Q15323 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT31Q15323 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT31Q15323 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT31Q15323 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT31Q15323 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT31Q15323 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT31Q15323 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT31Q15323 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT31Q15323 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT31Q15323 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT31Q15323 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT31Q15323 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT31Q15323 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT31Q15323 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT31Q15323 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT31Q15323 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT31Q15323 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT31Q15323 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT31Q15323 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT31Q15323 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT31Q15323 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT31Q15323 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT31Q15323 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT31Q15323 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT31Q15323 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT31Q15323 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT31Q15323 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT31Q15323 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT31Q15323 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT31Q15323 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT31Q15323 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KRT31Q15323 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT31Q15323 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
KRT31Q15323 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KRT31Q15323 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
KRT31Q15323 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT31Q15323 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT31Q15323 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT31Q15323 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT31Q15323 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT31Q15323 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT31Q15323 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT31Q15323 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT31Q15323 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT31Q15323 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT31Q15323 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT31Q15323 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT31Q15323 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KRT31Q15323 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT31Q15323 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT31Q15323 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT31Q15323 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT31Q15323 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT31Q15323 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT31Q15323 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT31Q15323 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT31Q15323 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT31Q15323 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT31Q15323 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT31Q15323 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT31Q15323 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT31Q15323 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT31Q15323 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT31Q15323 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT31Q15323 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT31Q15323 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT31Q15323 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT31Q15323 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT31Q15323 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT31Q15323 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT31Q15323 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT31Q15323 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT31Q15323 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT31Q15323 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT31Q15323 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT31Q15323 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms