Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBX1Q14549 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBX1Q14549 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GBX1Q14549 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBX1Q14549 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBX1Q14549 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBX1Q14549 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBX1Q14549 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBX1Q14549 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBX1Q14549 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBX1Q14549 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GBX1Q14549 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBX1Q14549 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBX1Q14549 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBX1Q14549 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBX1Q14549 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBX1Q14549 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBX1Q14549 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBX1Q14549 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBX1Q14549 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBX1Q14549 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBX1Q14549 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBX1Q14549 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GBX1Q14549 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBX1Q14549 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBX1Q14549 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBX1Q14549 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBX1Q14549 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBX1Q14549 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GBX1Q14549 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GBX1Q14549 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GBX1Q14549 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBX1Q14549 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBX1Q14549 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBX1Q14549 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBX1Q14549 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBX1Q14549 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBX1Q14549 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBX1Q14549 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBX1Q14549 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBX1Q14549 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBX1Q14549 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBX1Q14549 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBX1Q14549 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBX1Q14549 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBX1Q14549 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBX1Q14549 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBX1Q14549 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBX1Q14549 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBX1Q14549 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBX1Q14549 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBX1Q14549 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBX1Q14549 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBX1Q14549 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBX1Q14549 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBX1Q14549 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBX1Q14549 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBX1Q14549 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBX1Q14549 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
GBX1Q14549 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GBX1Q14549 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GBX1Q14549 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GBX1Q14549 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GBX1Q14549 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBX1Q14549 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBX1Q14549 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
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