Protein–RNA interactions for Protein: Q13477

MADCAM1, Mucosal addressin cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MADCAM1Q13477 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MADCAM1Q13477 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MADCAM1Q13477 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MADCAM1Q13477 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MADCAM1Q13477 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MADCAM1Q13477 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MADCAM1Q13477 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MADCAM1Q13477 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MADCAM1Q13477 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MADCAM1Q13477 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MADCAM1Q13477 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MADCAM1Q13477 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MADCAM1Q13477 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MADCAM1Q13477 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MADCAM1Q13477 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MADCAM1Q13477 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MADCAM1Q13477 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MADCAM1Q13477 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MADCAM1Q13477 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MADCAM1Q13477 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MADCAM1Q13477 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MADCAM1Q13477 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MADCAM1Q13477 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MADCAM1Q13477 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MADCAM1Q13477 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MADCAM1Q13477 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MADCAM1Q13477 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MADCAM1Q13477 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MADCAM1Q13477 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MADCAM1Q13477 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MADCAM1Q13477 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MADCAM1Q13477 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MADCAM1Q13477 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MADCAM1Q13477 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MADCAM1Q13477 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MADCAM1Q13477 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MADCAM1Q13477 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MADCAM1Q13477 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MADCAM1Q13477 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MADCAM1Q13477 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MADCAM1Q13477 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MADCAM1Q13477 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MADCAM1Q13477 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MADCAM1Q13477 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MADCAM1Q13477 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MADCAM1Q13477 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MADCAM1Q13477 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MADCAM1Q13477 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MADCAM1Q13477 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MADCAM1Q13477 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MADCAM1Q13477 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MADCAM1Q13477 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MADCAM1Q13477 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MADCAM1Q13477 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MADCAM1Q13477 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MADCAM1Q13477 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MADCAM1Q13477 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MADCAM1Q13477 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MADCAM1Q13477 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MADCAM1Q13477 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MADCAM1Q13477 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MADCAM1Q13477 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MADCAM1Q13477 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MADCAM1Q13477 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MADCAM1Q13477 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MADCAM1Q13477 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MADCAM1Q13477 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MADCAM1Q13477 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MADCAM1Q13477 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MADCAM1Q13477 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MADCAM1Q13477 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MADCAM1Q13477 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MADCAM1Q13477 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MADCAM1Q13477 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MADCAM1Q13477 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MADCAM1Q13477 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MADCAM1Q13477 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MADCAM1Q13477 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MADCAM1Q13477 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MADCAM1Q13477 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MADCAM1Q13477 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MADCAM1Q13477 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MADCAM1Q13477 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MADCAM1Q13477 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MADCAM1Q13477 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MADCAM1Q13477 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MADCAM1Q13477 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MADCAM1Q13477 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MADCAM1Q13477 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MADCAM1Q13477 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MADCAM1Q13477 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MADCAM1Q13477 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MADCAM1Q13477 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MADCAM1Q13477 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MADCAM1Q13477 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MADCAM1Q13477 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MADCAM1Q13477 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MADCAM1Q13477 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MADCAM1Q13477 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MADCAM1Q13477 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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