Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATMQ13315 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATMQ13315 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATMQ13315 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATMQ13315 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATMQ13315 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATMQ13315 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATMQ13315 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATMQ13315 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATMQ13315 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATMQ13315 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATMQ13315 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATMQ13315 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATMQ13315 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATMQ13315 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATMQ13315 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATMQ13315 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATMQ13315 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATMQ13315 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATMQ13315 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATMQ13315 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATMQ13315 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATMQ13315 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATMQ13315 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATMQ13315 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATMQ13315 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATMQ13315 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATMQ13315 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATMQ13315 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATMQ13315 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATMQ13315 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATMQ13315 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATMQ13315 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATMQ13315 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATMQ13315 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATMQ13315 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATMQ13315 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATMQ13315 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATMQ13315 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATMQ13315 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATMQ13315 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATMQ13315 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATMQ13315 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATMQ13315 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATMQ13315 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATMQ13315 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATMQ13315 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATMQ13315 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATMQ13315 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATMQ13315 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATMQ13315 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATMQ13315 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATMQ13315 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATMQ13315 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATMQ13315 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATMQ13315 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATMQ13315 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATMQ13315 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATMQ13315 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATMQ13315 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATMQ13315 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATMQ13315 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATMQ13315 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ATMQ13315 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATMQ13315 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATMQ13315 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATMQ13315 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATMQ13315 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATMQ13315 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ATMQ13315 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATMQ13315 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATMQ13315 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATMQ13315 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATMQ13315 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATMQ13315 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATMQ13315 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATMQ13315 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATMQ13315 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATMQ13315 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATMQ13315 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATMQ13315 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATMQ13315 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATMQ13315 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATMQ13315 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATMQ13315 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATMQ13315 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATMQ13315 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATMQ13315 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATMQ13315 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATMQ13315 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATMQ13315 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATMQ13315 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATMQ13315 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATMQ13315 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATMQ13315 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATMQ13315 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATMQ13315 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATMQ13315 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATMQ13315 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATMQ13315 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
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