Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.835e-11■■■■■ 46.3
TARDBPQ13148 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.85e-11■■■■■ 46.3
TARDBPQ13148 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.725e-11■■■■■ 46.3
TARDBPQ13148 TANGO2-211ENST00000434168 862 ntTSL 319.15■□□□□ 0.665e-11■■■■■ 46.3
TARDBPQ13148 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.625e-11■■■■■ 46.3
TARDBPQ13148 TANGO2-216ENST00000450664 570 ntTSL 418.25■□□□□ 0.515e-11■■■■■ 46.3
TARDBPQ13148 TANGO2-219ENST00000471707 745 ntTSL 516.88■□□□□ 0.295e-11■■■■■ 46.3
TARDBPQ13148 TANGO2-218ENST00000462579 649 ntTSL 416.71■□□□□ 0.275e-11■■■■■ 46.3
TARDBPQ13148 TANGO2-203ENST00000399807 2241 ntTSL 516.46■□□□□ 0.235e-11■■■■■ 46.3
TARDBPQ13148 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.15e-11■■■■■ 46.3
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TARDBPQ13148 TANGO2-213ENST00000444651 847 ntTSL 313.98□□□□□ -0.175e-11■■■■■ 46.3
TARDBPQ13148 TANGO2-224ENST00000485715 617 ntTSL 513.63□□□□□ -0.235e-11■■■■■ 46.3
TARDBPQ13148 TANGO2-209ENST00000432198 585 ntTSL 412.18□□□□□ -0.465e-11■■■■■ 46.3
TARDBPQ13148 TANGO2-223ENST00000484373 3109 ntTSL 412.04□□□□□ -0.485e-11■■■■■ 46.3
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TARDBPQ13148 MARK3-215ENST00000558787 758 ntTSL 27.12□□□□□ -1.274e-7■■■■■ 46.2
TARDBPQ13148 AC002480.1-201ENST00000442252 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.824e-17■■■■■ 46.1
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TARDBPQ13148 GGA2-213ENST00000568922 1807 ntTSL 211.63□□□□□ -0.559e-25■■■■■ 46.1
TARDBPQ13148 GGA2-210ENST00000567339 293 ntTSL 39.57□□□□□ -0.889e-25■■■■■ 46.1
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TARDBPQ13148 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.213e-8■■■■■ 46
TARDBPQ13148 CDK6-203ENST00000467166 779 ntTSL 27.18□□□□□ -1.268e-19■■■■■ 46
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TARDBPQ13148 ALG13-231ENST00000623255 585 ntTSL 33.87□□□□□ -1.793e-24■■■■■ 45.7
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TARDBPQ13148 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.283e-7■■■■■ 44.7
TARDBPQ13148 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.073e-7■■■■■ 44.7
TARDBPQ13148 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 13e-7■■■■■ 44.7
TARDBPQ13148 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.523e-7■■■■■ 44.7
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TARDBPQ13148 PANK3-201ENST00000239231 10506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 44.6
TARDBPQ13148 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 44.6
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TARDBPQ13148 NR2F2-AS1-203ENST00000558929 574 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.862e-7■■■■■ 44.6
TARDBPQ13148 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.332e-7■■■■■ 44.6
TARDBPQ13148 PUDP-201ENST00000381077 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.54e-26■■■■■ 44.5
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TARDBPQ13148 CEP72-202ENST00000499639 461 ntTSL 310.62□□□□□ -0.714e-11■■■■■ 44.4
TARDBPQ13148 CNOT8-215ENST00000521174 485 ntTSL 518.8■□□□□ 0.69e-7■■■■■ 44.3
TARDBPQ13148 CNOT8-205ENST00000518028 516 ntTSL 416.98■□□□□ 0.319e-7■■■■■ 44.3
TARDBPQ13148 CNOT8-211ENST00000519430 562 ntTSL 416.98■□□□□ 0.319e-7■■■■■ 44.3
TARDBPQ13148 CNOT8-209ENST00000519394 500 ntTSL 313.68□□□□□ -0.229e-7■■■■■ 44.3
TARDBPQ13148 ZGPAT-207ENST00000468235 594 ntTSL 1 (best)18.75■□□□□ 0.593e-7■■■■■ 44
TARDBPQ13148 NOL4L-209ENST00000485364 885 ntTSL 1 (best)24.36■■□□□ 1.496e-8■■■■■ 44
TARDBPQ13148 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.063e-17■■■■■ 44
TARDBPQ13148 FAM178B-205ENST00000494172 592 ntTSL 317.74■□□□□ 0.438e-8■■■■■ 43.9
TARDBPQ13148 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.148e-8■■■■■ 43.9
TARDBPQ13148 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.378e-8■■■■■ 43.9
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TARDBPQ13148 COPA-201ENST00000241704 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.721e-12■■■■■ 43.6
TARDBPQ13148 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.066e-7■■■■■ 43.6
TARDBPQ13148 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.126e-7■■■■■ 43.6
TARDBPQ13148 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.297e-12■■■■■ 43.6
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