Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBBP4Q09028 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBBP4Q09028 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBBP4Q09028 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBBP4Q09028 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBBP4Q09028 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBBP4Q09028 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBBP4Q09028 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBBP4Q09028 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBBP4Q09028 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBBP4Q09028 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBBP4Q09028 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBBP4Q09028 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBBP4Q09028 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBBP4Q09028 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBBP4Q09028 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBBP4Q09028 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBBP4Q09028 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBBP4Q09028 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBBP4Q09028 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBBP4Q09028 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBBP4Q09028 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBBP4Q09028 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBBP4Q09028 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RBBP4Q09028 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBBP4Q09028 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBBP4Q09028 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBBP4Q09028 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBBP4Q09028 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBBP4Q09028 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBBP4Q09028 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBBP4Q09028 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBBP4Q09028 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RBBP4Q09028 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP4Q09028 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP4Q09028 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP4Q09028 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP4Q09028 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP4Q09028 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP4Q09028 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP4Q09028 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP4Q09028 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBBP4Q09028 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBBP4Q09028 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBBP4Q09028 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBBP4Q09028 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBBP4Q09028 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RBBP4Q09028 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBBP4Q09028 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBBP4Q09028 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBBP4Q09028 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBBP4Q09028 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBBP4Q09028 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBBP4Q09028 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RBBP4Q09028 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RBBP4Q09028 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP4Q09028 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP4Q09028 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP4Q09028 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP4Q09028 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP4Q09028 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP4Q09028 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP4Q09028 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP4Q09028 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBBP4Q09028 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBBP4Q09028 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBBP4Q09028 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBBP4Q09028 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP4Q09028 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP4Q09028 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP4Q09028 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP4Q09028 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP4Q09028 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP4Q09028 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP4Q09028 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP4Q09028 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP4Q09028 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP4Q09028 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP4Q09028 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP4Q09028 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP4Q09028 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBBP4Q09028 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBBP4Q09028 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP4Q09028 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP4Q09028 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP4Q09028 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP4Q09028 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP4Q09028 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP4Q09028 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBBP4Q09028 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBBP4Q09028 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBBP4Q09028 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBBP4Q09028 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBBP4Q09028 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBBP4Q09028 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBBP4Q09028 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBBP4Q09028 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBBP4Q09028 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBBP4Q09028 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBBP4Q09028 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms