Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EMX2Q04743 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EMX2Q04743 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EMX2Q04743 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EMX2Q04743 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EMX2Q04743 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EMX2Q04743 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EMX2Q04743 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMX2Q04743 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMX2Q04743 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMX2Q04743 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EMX2Q04743 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
EMX2Q04743 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EMX2Q04743 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EMX2Q04743 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EMX2Q04743 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMX2Q04743 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EMX2Q04743 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMX2Q04743 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMX2Q04743 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMX2Q04743 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMX2Q04743 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EMX2Q04743 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EMX2Q04743 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EMX2Q04743 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMX2Q04743 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMX2Q04743 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EMX2Q04743 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EMX2Q04743 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EMX2Q04743 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EMX2Q04743 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EMX2Q04743 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EMX2Q04743 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMX2Q04743 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMX2Q04743 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMX2Q04743 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMX2Q04743 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMX2Q04743 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EMX2Q04743 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EMX2Q04743 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EMX2Q04743 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EMX2Q04743 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EMX2Q04743 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EMX2Q04743 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EMX2Q04743 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EMX2Q04743 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EMX2Q04743 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EMX2Q04743 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EMX2Q04743 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EMX2Q04743 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EMX2Q04743 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EMX2Q04743 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EMX2Q04743 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EMX2Q04743 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMX2Q04743 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMX2Q04743 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMX2Q04743 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMX2Q04743 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMX2Q04743 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMX2Q04743 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMX2Q04743 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMX2Q04743 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMX2Q04743 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMX2Q04743 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EMX2Q04743 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMX2Q04743 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMX2Q04743 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMX2Q04743 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMX2Q04743 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMX2Q04743 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMX2Q04743 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMX2Q04743 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMX2Q04743 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMX2Q04743 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMX2Q04743 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMX2Q04743 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMX2Q04743 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMX2Q04743 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMX2Q04743 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMX2Q04743 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMX2Q04743 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EMX2Q04743 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EMX2Q04743 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EMX2Q04743 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EMX2Q04743 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMX2Q04743 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMX2Q04743 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMX2Q04743 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMX2Q04743 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EMX2Q04743 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMX2Q04743 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMX2Q04743 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EMX2Q04743 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EMX2Q04743 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EMX2Q04743 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EMX2Q04743 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EMX2Q04743 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EMX2Q04743 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EMX2Q04743 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EMX2Q04743 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms