Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC45.63■■■■■ 4.9
ERCC6Q03468 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC45.63■■■■■ 4.9
ERCC6Q03468 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC45.62■■■■■ 4.89
ERCC6Q03468 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC45.61■■■■■ 4.89
ERCC6Q03468 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC45.61■■■■■ 4.89
ERCC6Q03468 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
ERCC6Q03468 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
ERCC6Q03468 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
ERCC6Q03468 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC45.59■■■■■ 4.89
ERCC6Q03468 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
ERCC6Q03468 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.58■■■■■ 4.89
ERCC6Q03468 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC45.58■■■■■ 4.89
ERCC6Q03468 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
ERCC6Q03468 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
ERCC6Q03468 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
ERCC6Q03468 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC45.55■■■■■ 4.88
ERCC6Q03468 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.55■■■■■ 4.88
ERCC6Q03468 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
ERCC6Q03468 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC45.55■■■■■ 4.88
ERCC6Q03468 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC45.55■■■■■ 4.88
ERCC6Q03468 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC45.54■■■■■ 4.88
ERCC6Q03468 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
ERCC6Q03468 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC45.54■■■■■ 4.88
ERCC6Q03468 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC45.54■■■■■ 4.88
ERCC6Q03468 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
ERCC6Q03468 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC45.5■■■■■ 4.87
ERCC6Q03468 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
ERCC6Q03468 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
ERCC6Q03468 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
ERCC6Q03468 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC45.48■■■■■ 4.87
ERCC6Q03468 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.45■■■■■ 4.87
ERCC6Q03468 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC45.45■■■■■ 4.87
ERCC6Q03468 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC45.44■■■■■ 4.87
ERCC6Q03468 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.42■■■■■ 4.86
ERCC6Q03468 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
ERCC6Q03468 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
ERCC6Q03468 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
ERCC6Q03468 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC45.4■■■■■ 4.86
ERCC6Q03468 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC45.39■■■■■ 4.86
ERCC6Q03468 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.38■■■■■ 4.86
ERCC6Q03468 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC45.38■■■■■ 4.86
ERCC6Q03468 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
ERCC6Q03468 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
ERCC6Q03468 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC45.36■■■■■ 4.85
ERCC6Q03468 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
ERCC6Q03468 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
ERCC6Q03468 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC45.34■■■■■ 4.85
ERCC6Q03468 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.32■■■■■ 4.85
ERCC6Q03468 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
ERCC6Q03468 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC45.31■■■■■ 4.84
ERCC6Q03468 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
ERCC6Q03468 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC45.31■■■■■ 4.84
ERCC6Q03468 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
ERCC6Q03468 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
ERCC6Q03468 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
ERCC6Q03468 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
ERCC6Q03468 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
ERCC6Q03468 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
ERCC6Q03468 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
ERCC6Q03468 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC45.23■■■■■ 4.83
ERCC6Q03468 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC45.23■■■■■ 4.83
ERCC6Q03468 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
ERCC6Q03468 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
ERCC6Q03468 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.23■■■■■ 4.83
ERCC6Q03468 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.23■■■■■ 4.83
ERCC6Q03468 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC45.23■■■■■ 4.83
ERCC6Q03468 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC45.22■■■■■ 4.83
ERCC6Q03468 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC45.22■■■■■ 4.83
ERCC6Q03468 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
ERCC6Q03468 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
ERCC6Q03468 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC45.22■■■■■ 4.83
ERCC6Q03468 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC45.22■■■■■ 4.83
ERCC6Q03468 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
ERCC6Q03468 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
ERCC6Q03468 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
ERCC6Q03468 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.2■■■■■ 4.83
ERCC6Q03468 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
ERCC6Q03468 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC45.19■■■■■ 4.82
ERCC6Q03468 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.18■■■■■ 4.82
ERCC6Q03468 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
ERCC6Q03468 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
ERCC6Q03468 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC45.16■■■■■ 4.82
ERCC6Q03468 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.16■■■■■ 4.82
ERCC6Q03468 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
ERCC6Q03468 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.13■■■■■ 4.82
ERCC6Q03468 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC45.11■■■■■ 4.81
ERCC6Q03468 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC45.1■■■■■ 4.81
ERCC6Q03468 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC45.1■■■■■ 4.81
ERCC6Q03468 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
ERCC6Q03468 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC45.09■■■■■ 4.81
ERCC6Q03468 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
ERCC6Q03468 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
ERCC6Q03468 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC45.08■■■■■ 4.81
ERCC6Q03468 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
ERCC6Q03468 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC45.07■■■■■ 4.81
ERCC6Q03468 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
ERCC6Q03468 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.07■■■■■ 4.81
ERCC6Q03468 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC45.06■■■■■ 4.8
ERCC6Q03468 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC45.06■■■■■ 4.8
ERCC6Q03468 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.2 ms