Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ERVK-24P63145 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERVK-24P63145 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERVK-24P63145 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERVK-24P63145 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
ERVK-24P63145 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ERVK-24P63145 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ERVK-24P63145 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
ERVK-24P63145 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERVK-24P63145 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERVK-24P63145 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERVK-24P63145 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ERVK-24P63145 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ERVK-24P63145 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ERVK-24P63145 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ERVK-24P63145 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ERVK-24P63145 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
ERVK-24P63145 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERVK-24P63145 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERVK-24P63145 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERVK-24P63145 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ERVK-24P63145 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ERVK-24P63145 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ERVK-24P63145 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ERVK-24P63145 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ERVK-24P63145 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ERVK-24P63145 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERVK-24P63145 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERVK-24P63145 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERVK-24P63145 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERVK-24P63145 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERVK-24P63145 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ERVK-24P63145 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ERVK-24P63145 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ERVK-24P63145 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ERVK-24P63145 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ERVK-24P63145 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ERVK-24P63145 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
ERVK-24P63145 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERVK-24P63145 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERVK-24P63145 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERVK-24P63145 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERVK-24P63145 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERVK-24P63145 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERVK-24P63145 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERVK-24P63145 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ERVK-24P63145 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ERVK-24P63145 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ERVK-24P63145 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ERVK-24P63145 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ERVK-24P63145 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ERVK-24P63145 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ERVK-24P63145 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ERVK-24P63145 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ERVK-24P63145 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ERVK-24P63145 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
ERVK-24P63145 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ERVK-24P63145 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
ERVK-24P63145 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
ERVK-24P63145 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ERVK-24P63145 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERVK-24P63145 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
ERVK-24P63145 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
ERVK-24P63145 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERVK-24P63145 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERVK-24P63145 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERVK-24P63145 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ERVK-24P63145 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ERVK-24P63145 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERVK-24P63145 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERVK-24P63145 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERVK-24P63145 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERVK-24P63145 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERVK-24P63145 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERVK-24P63145 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ERVK-24P63145 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ERVK-24P63145 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERVK-24P63145 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERVK-24P63145 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERVK-24P63145 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERVK-24P63145 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERVK-24P63145 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERVK-24P63145 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ERVK-24P63145 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ERVK-24P63145 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERVK-24P63145 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERVK-24P63145 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERVK-24P63145 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ERVK-24P63145 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERVK-24P63145 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERVK-24P63145 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERVK-24P63145 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERVK-24P63145 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ERVK-24P63145 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ERVK-24P63145 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ERVK-24P63145 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ERVK-24P63145 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERVK-24P63145 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERVK-24P63145 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERVK-24P63145 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms