Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMC1P62191 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMC1P62191 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMC1P62191 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMC1P62191 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMC1P62191 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMC1P62191 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMC1P62191 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMC1P62191 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMC1P62191 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMC1P62191 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMC1P62191 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMC1P62191 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMC1P62191 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMC1P62191 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMC1P62191 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMC1P62191 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMC1P62191 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMC1P62191 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMC1P62191 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMC1P62191 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMC1P62191 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMC1P62191 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMC1P62191 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMC1P62191 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMC1P62191 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMC1P62191 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMC1P62191 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PSMC1P62191 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PSMC1P62191 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMC1P62191 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMC1P62191 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMC1P62191 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMC1P62191 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMC1P62191 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMC1P62191 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMC1P62191 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMC1P62191 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMC1P62191 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMC1P62191 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMC1P62191 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMC1P62191 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMC1P62191 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMC1P62191 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMC1P62191 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMC1P62191 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMC1P62191 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMC1P62191 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMC1P62191 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMC1P62191 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMC1P62191 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMC1P62191 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMC1P62191 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMC1P62191 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMC1P62191 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSMC1P62191 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSMC1P62191 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMC1P62191 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMC1P62191 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMC1P62191 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMC1P62191 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMC1P62191 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSMC1P62191 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSMC1P62191 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMC1P62191 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMC1P62191 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.8 ms