Protein–RNA interactions for Protein: P59046

NLRP12, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP12P59046 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRP12P59046 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRP12P59046 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRP12P59046 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRP12P59046 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRP12P59046 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP12P59046 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP12P59046 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP12P59046 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP12P59046 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP12P59046 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP12P59046 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP12P59046 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP12P59046 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP12P59046 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP12P59046 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP12P59046 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP12P59046 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP12P59046 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP12P59046 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP12P59046 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NLRP12P59046 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NLRP12P59046 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP12P59046 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP12P59046 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP12P59046 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP12P59046 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP12P59046 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP12P59046 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP12P59046 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP12P59046 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP12P59046 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP12P59046 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP12P59046 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP12P59046 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP12P59046 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP12P59046 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP12P59046 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NLRP12P59046 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP12P59046 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP12P59046 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP12P59046 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP12P59046 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP12P59046 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP12P59046 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP12P59046 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP12P59046 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP12P59046 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP12P59046 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP12P59046 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP12P59046 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP12P59046 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP12P59046 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP12P59046 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NLRP12P59046 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP12P59046 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP12P59046 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP12P59046 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP12P59046 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP12P59046 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP12P59046 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP12P59046 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP12P59046 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP12P59046 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP12P59046 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP12P59046 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP12P59046 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP12P59046 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP12P59046 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP12P59046 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP12P59046 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP12P59046 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP12P59046 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP12P59046 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP12P59046 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP12P59046 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP12P59046 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP12P59046 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP12P59046 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP12P59046 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP12P59046 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP12P59046 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP12P59046 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP12P59046 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP12P59046 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP12P59046 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP12P59046 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP12P59046 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP12P59046 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP12P59046 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP12P59046 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP12P59046 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP12P59046 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP12P59046 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP12P59046 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP12P59046 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP12P59046 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP12P59046 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NLRP12P59046 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NLRP12P59046 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms