Protein–RNA interactions for Protein: P58511

SMIM11A, Small integral membrane protein 11A, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM11AP58511 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM11AP58511 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM11AP58511 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM11AP58511 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM11AP58511 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM11AP58511 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM11AP58511 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM11AP58511 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM11AP58511 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM11AP58511 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM11AP58511 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM11AP58511 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM11AP58511 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM11AP58511 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM11AP58511 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM11AP58511 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM11AP58511 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM11AP58511 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM11AP58511 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM11AP58511 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM11AP58511 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM11AP58511 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM11AP58511 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM11AP58511 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM11AP58511 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM11AP58511 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM11AP58511 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM11AP58511 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM11AP58511 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM11AP58511 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM11AP58511 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM11AP58511 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM11AP58511 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM11AP58511 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM11AP58511 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM11AP58511 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM11AP58511 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM11AP58511 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM11AP58511 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM11AP58511 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMIM11AP58511 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMIM11AP58511 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM11AP58511 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM11AP58511 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM11AP58511 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM11AP58511 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM11AP58511 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM11AP58511 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM11AP58511 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM11AP58511 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM11AP58511 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM11AP58511 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM11AP58511 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM11AP58511 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM11AP58511 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM11AP58511 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM11AP58511 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM11AP58511 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM11AP58511 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM11AP58511 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM11AP58511 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM11AP58511 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM11AP58511 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM11AP58511 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMIM11AP58511 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM11AP58511 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM11AP58511 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM11AP58511 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM11AP58511 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM11AP58511 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM11AP58511 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM11AP58511 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM11AP58511 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM11AP58511 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM11AP58511 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM11AP58511 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM11AP58511 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM11AP58511 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM11AP58511 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM11AP58511 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM11AP58511 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM11AP58511 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM11AP58511 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM11AP58511 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM11AP58511 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM11AP58511 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM11AP58511 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM11AP58511 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM11AP58511 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM11AP58511 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM11AP58511 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM11AP58511 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM11AP58511 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMIM11AP58511 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMIM11AP58511 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM11AP58511 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM11AP58511 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM11AP58511 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM11AP58511 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM11AP58511 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms