Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
BRPF1P55201 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
BRPF1P55201 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
BRPF1P55201 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
BRPF1P55201 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.96■■■□□ 2.87
BRPF1P55201 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
BRPF1P55201 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
BRPF1P55201 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
BRPF1P55201 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
BRPF1P55201 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
BRPF1P55201 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
BRPF1P55201 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
BRPF1P55201 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
BRPF1P55201 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
BRPF1P55201 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
BRPF1P55201 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
BRPF1P55201 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
BRPF1P55201 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
BRPF1P55201 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
BRPF1P55201 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
BRPF1P55201 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
BRPF1P55201 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
BRPF1P55201 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
BRPF1P55201 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
BRPF1P55201 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
BRPF1P55201 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
BRPF1P55201 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
BRPF1P55201 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
BRPF1P55201 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
BRPF1P55201 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
BRPF1P55201 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
BRPF1P55201 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
BRPF1P55201 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
BRPF1P55201 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
BRPF1P55201 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
BRPF1P55201 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
BRPF1P55201 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
BRPF1P55201 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
BRPF1P55201 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
BRPF1P55201 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
BRPF1P55201 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
BRPF1P55201 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
BRPF1P55201 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
BRPF1P55201 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
BRPF1P55201 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
BRPF1P55201 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
BRPF1P55201 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.84■■■□□ 2.85
BRPF1P55201 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
BRPF1P55201 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
BRPF1P55201 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
BRPF1P55201 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
BRPF1P55201 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
BRPF1P55201 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
BRPF1P55201 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
BRPF1P55201 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
BRPF1P55201 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
BRPF1P55201 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
BRPF1P55201 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
BRPF1P55201 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
BRPF1P55201 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
BRPF1P55201 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
BRPF1P55201 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
BRPF1P55201 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
BRPF1P55201 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
BRPF1P55201 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
BRPF1P55201 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
BRPF1P55201 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
BRPF1P55201 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
BRPF1P55201 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
BRPF1P55201 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
BRPF1P55201 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
BRPF1P55201 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
BRPF1P55201 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
BRPF1P55201 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
BRPF1P55201 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
BRPF1P55201 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
BRPF1P55201 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
BRPF1P55201 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
BRPF1P55201 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
BRPF1P55201 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
BRPF1P55201 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
BRPF1P55201 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
BRPF1P55201 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
BRPF1P55201 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
BRPF1P55201 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
BRPF1P55201 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
BRPF1P55201 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
BRPF1P55201 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
BRPF1P55201 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
BRPF1P55201 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
BRPF1P55201 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
BRPF1P55201 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
BRPF1P55201 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
BRPF1P55201 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
BRPF1P55201 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
BRPF1P55201 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
BRPF1P55201 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
BRPF1P55201 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
BRPF1P55201 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
BRPF1P55201 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms