Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CACNB3P54284 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CACNB3P54284 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CACNB3P54284 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CACNB3P54284 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CACNB3P54284 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CACNB3P54284 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CACNB3P54284 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CACNB3P54284 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CACNB3P54284 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CACNB3P54284 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CACNB3P54284 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
CACNB3P54284 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CACNB3P54284 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CACNB3P54284 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CACNB3P54284 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CACNB3P54284 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CACNB3P54284 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CACNB3P54284 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CACNB3P54284 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CACNB3P54284 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CACNB3P54284 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CACNB3P54284 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CACNB3P54284 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CACNB3P54284 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CACNB3P54284 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CACNB3P54284 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CACNB3P54284 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CACNB3P54284 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CACNB3P54284 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CACNB3P54284 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CACNB3P54284 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CACNB3P54284 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CACNB3P54284 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CACNB3P54284 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CACNB3P54284 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CACNB3P54284 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CACNB3P54284 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CACNB3P54284 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CACNB3P54284 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CACNB3P54284 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CACNB3P54284 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
CACNB3P54284 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CACNB3P54284 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CACNB3P54284 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CACNB3P54284 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CACNB3P54284 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CACNB3P54284 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CACNB3P54284 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CACNB3P54284 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CACNB3P54284 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CACNB3P54284 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CACNB3P54284 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CACNB3P54284 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CACNB3P54284 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CACNB3P54284 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CACNB3P54284 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CACNB3P54284 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CACNB3P54284 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CACNB3P54284 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CACNB3P54284 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CACNB3P54284 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CACNB3P54284 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CACNB3P54284 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CACNB3P54284 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CACNB3P54284 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CACNB3P54284 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CACNB3P54284 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CACNB3P54284 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CACNB3P54284 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CACNB3P54284 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CACNB3P54284 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CACNB3P54284 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CACNB3P54284 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CACNB3P54284 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CACNB3P54284 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CACNB3P54284 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CACNB3P54284 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CACNB3P54284 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CACNB3P54284 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CACNB3P54284 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CACNB3P54284 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CACNB3P54284 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CACNB3P54284 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CACNB3P54284 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CACNB3P54284 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CACNB3P54284 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CACNB3P54284 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CACNB3P54284 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CACNB3P54284 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CACNB3P54284 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CACNB3P54284 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CACNB3P54284 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CACNB3P54284 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CACNB3P54284 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CACNB3P54284 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CACNB3P54284 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CACNB3P54284 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CACNB3P54284 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
CACNB3P54284 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.4 ms