Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KPNA2P52292 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KPNA2P52292 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KPNA2P52292 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KPNA2P52292 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KPNA2P52292 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KPNA2P52292 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KPNA2P52292 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KPNA2P52292 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KPNA2P52292 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KPNA2P52292 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KPNA2P52292 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KPNA2P52292 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KPNA2P52292 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KPNA2P52292 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KPNA2P52292 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KPNA2P52292 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KPNA2P52292 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KPNA2P52292 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KPNA2P52292 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KPNA2P52292 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KPNA2P52292 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KPNA2P52292 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KPNA2P52292 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KPNA2P52292 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KPNA2P52292 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KPNA2P52292 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KPNA2P52292 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KPNA2P52292 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KPNA2P52292 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KPNA2P52292 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KPNA2P52292 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KPNA2P52292 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KPNA2P52292 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KPNA2P52292 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KPNA2P52292 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KPNA2P52292 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KPNA2P52292 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KPNA2P52292 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KPNA2P52292 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KPNA2P52292 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KPNA2P52292 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KPNA2P52292 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KPNA2P52292 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KPNA2P52292 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KPNA2P52292 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KPNA2P52292 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KPNA2P52292 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KPNA2P52292 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KPNA2P52292 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KPNA2P52292 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KPNA2P52292 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KPNA2P52292 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KPNA2P52292 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KPNA2P52292 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KPNA2P52292 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KPNA2P52292 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KPNA2P52292 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KPNA2P52292 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KPNA2P52292 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KPNA2P52292 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KPNA2P52292 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KPNA2P52292 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms