Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PSEN1P49768 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PSEN1P49768 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PSEN1P49768 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PSEN1P49768 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PSEN1P49768 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PSEN1P49768 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PSEN1P49768 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PSEN1P49768 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSEN1P49768 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSEN1P49768 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSEN1P49768 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSEN1P49768 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSEN1P49768 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSEN1P49768 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PSEN1P49768 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PSEN1P49768 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PSEN1P49768 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSEN1P49768 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSEN1P49768 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSEN1P49768 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PSEN1P49768 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSEN1P49768 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSEN1P49768 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSEN1P49768 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSEN1P49768 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSEN1P49768 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSEN1P49768 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSEN1P49768 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSEN1P49768 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PSEN1P49768 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PSEN1P49768 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PSEN1P49768 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSEN1P49768 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PSEN1P49768 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSEN1P49768 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSEN1P49768 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSEN1P49768 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSEN1P49768 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSEN1P49768 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSEN1P49768 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSEN1P49768 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSEN1P49768 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSEN1P49768 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PSEN1P49768 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSEN1P49768 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSEN1P49768 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSEN1P49768 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PSEN1P49768 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSEN1P49768 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSEN1P49768 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSEN1P49768 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PSEN1P49768 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSEN1P49768 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSEN1P49768 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSEN1P49768 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PSEN1P49768 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSEN1P49768 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSEN1P49768 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSEN1P49768 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSEN1P49768 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSEN1P49768 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSEN1P49768 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSEN1P49768 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSEN1P49768 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSEN1P49768 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSEN1P49768 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSEN1P49768 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSEN1P49768 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSEN1P49768 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PSEN1P49768 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PSEN1P49768 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSEN1P49768 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSEN1P49768 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSEN1P49768 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSEN1P49768 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSEN1P49768 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSEN1P49768 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PSEN1P49768 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSEN1P49768 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSEN1P49768 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSEN1P49768 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSEN1P49768 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSEN1P49768 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSEN1P49768 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSEN1P49768 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSEN1P49768 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSEN1P49768 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PSEN1P49768 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSEN1P49768 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSEN1P49768 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSEN1P49768 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSEN1P49768 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSEN1P49768 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSEN1P49768 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSEN1P49768 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PSEN1P49768 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSEN1P49768 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSEN1P49768 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSEN1P49768 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms