Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PIP4K2AP48426 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PIP4K2AP48426 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PIP4K2AP48426 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PIP4K2AP48426 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PIP4K2AP48426 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PIP4K2AP48426 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PIP4K2AP48426 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
PIP4K2AP48426 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PIP4K2AP48426 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PIP4K2AP48426 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PIP4K2AP48426 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PIP4K2AP48426 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PIP4K2AP48426 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PIP4K2AP48426 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PIP4K2AP48426 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PIP4K2AP48426 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PIP4K2AP48426 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
PIP4K2AP48426 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
PIP4K2AP48426 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PIP4K2AP48426 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PIP4K2AP48426 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PIP4K2AP48426 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PIP4K2AP48426 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PIP4K2AP48426 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PIP4K2AP48426 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PIP4K2AP48426 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PIP4K2AP48426 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PIP4K2AP48426 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PIP4K2AP48426 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PIP4K2AP48426 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PIP4K2AP48426 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PIP4K2AP48426 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
PIP4K2AP48426 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PIP4K2AP48426 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PIP4K2AP48426 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PIP4K2AP48426 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PIP4K2AP48426 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PIP4K2AP48426 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PIP4K2AP48426 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PIP4K2AP48426 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
PIP4K2AP48426 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PIP4K2AP48426 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PIP4K2AP48426 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
PIP4K2AP48426 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
PIP4K2AP48426 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms