Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPD2P43304 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPD2P43304 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPD2P43304 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPD2P43304 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPD2P43304 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPD2P43304 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPD2P43304 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPD2P43304 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GPD2P43304 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GPD2P43304 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPD2P43304 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPD2P43304 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPD2P43304 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPD2P43304 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPD2P43304 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPD2P43304 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPD2P43304 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPD2P43304 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPD2P43304 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPD2P43304 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPD2P43304 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPD2P43304 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPD2P43304 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPD2P43304 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPD2P43304 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPD2P43304 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPD2P43304 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPD2P43304 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPD2P43304 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPD2P43304 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPD2P43304 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPD2P43304 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPD2P43304 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GPD2P43304 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPD2P43304 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPD2P43304 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GPD2P43304 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GPD2P43304 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GPD2P43304 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GPD2P43304 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPD2P43304 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPD2P43304 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPD2P43304 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPD2P43304 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPD2P43304 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPD2P43304 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPD2P43304 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GPD2P43304 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPD2P43304 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPD2P43304 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPD2P43304 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPD2P43304 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPD2P43304 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPD2P43304 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPD2P43304 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GPD2P43304 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPD2P43304 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GPD2P43304 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPD2P43304 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPD2P43304 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
GPD2P43304 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPD2P43304 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPD2P43304 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPD2P43304 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPD2P43304 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPD2P43304 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPD2P43304 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPD2P43304 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPD2P43304 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPD2P43304 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPD2P43304 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GPD2P43304 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPD2P43304 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPD2P43304 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPD2P43304 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPD2P43304 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
GPD2P43304 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GPD2P43304 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GPD2P43304 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GPD2P43304 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GPD2P43304 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPD2P43304 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPD2P43304 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPD2P43304 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPD2P43304 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPD2P43304 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPD2P43304 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPD2P43304 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPD2P43304 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPD2P43304 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPD2P43304 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPD2P43304 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GPD2P43304 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GPD2P43304 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GPD2P43304 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPD2P43304 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPD2P43304 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPD2P43304 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPD2P43304 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms