Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
LRPPRCP42704 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
LRPPRCP42704 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
LRPPRCP42704 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
LRPPRCP42704 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
LRPPRCP42704 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
LRPPRCP42704 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
LRPPRCP42704 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
LRPPRCP42704 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
LRPPRCP42704 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
LRPPRCP42704 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
LRPPRCP42704 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
LRPPRCP42704 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
LRPPRCP42704 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
LRPPRCP42704 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
LRPPRCP42704 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
LRPPRCP42704 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
LRPPRCP42704 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
LRPPRCP42704 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
LRPPRCP42704 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
LRPPRCP42704 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
LRPPRCP42704 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
LRPPRCP42704 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
LRPPRCP42704 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
LRPPRCP42704 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
LRPPRCP42704 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
LRPPRCP42704 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
LRPPRCP42704 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
LRPPRCP42704 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
LRPPRCP42704 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
LRPPRCP42704 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
LRPPRCP42704 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
LRPPRCP42704 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
LRPPRCP42704 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
LRPPRCP42704 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
LRPPRCP42704 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
LRPPRCP42704 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
LRPPRCP42704 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
LRPPRCP42704 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
LRPPRCP42704 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
LRPPRCP42704 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
LRPPRCP42704 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
LRPPRCP42704 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
LRPPRCP42704 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
LRPPRCP42704 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
LRPPRCP42704 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
LRPPRCP42704 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
LRPPRCP42704 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
LRPPRCP42704 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
LRPPRCP42704 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
LRPPRCP42704 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
LRPPRCP42704 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
LRPPRCP42704 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
LRPPRCP42704 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
LRPPRCP42704 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
LRPPRCP42704 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
LRPPRCP42704 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
LRPPRCP42704 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
LRPPRCP42704 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
LRPPRCP42704 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
LRPPRCP42704 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
LRPPRCP42704 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
LRPPRCP42704 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
LRPPRCP42704 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
LRPPRCP42704 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
LRPPRCP42704 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
LRPPRCP42704 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
LRPPRCP42704 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
LRPPRCP42704 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
LRPPRCP42704 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
LRPPRCP42704 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
LRPPRCP42704 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
LRPPRCP42704 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
LRPPRCP42704 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
LRPPRCP42704 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
LRPPRCP42704 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
LRPPRCP42704 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
LRPPRCP42704 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
LRPPRCP42704 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
LRPPRCP42704 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
LRPPRCP42704 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
LRPPRCP42704 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
LRPPRCP42704 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
LRPPRCP42704 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
LRPPRCP42704 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
LRPPRCP42704 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
LRPPRCP42704 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
LRPPRCP42704 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
LRPPRCP42704 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
LRPPRCP42704 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
LRPPRCP42704 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
LRPPRCP42704 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
LRPPRCP42704 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
LRPPRCP42704 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
LRPPRCP42704 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
LRPPRCP42704 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
LRPPRCP42704 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
LRPPRCP42704 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
LRPPRCP42704 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
LRPPRCP42704 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 638.6 ms