Protein–RNA interactions for Protein: P31930

UQCRC1, Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCRC1P31930 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UQCRC1P31930 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UQCRC1P31930 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UQCRC1P31930 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UQCRC1P31930 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UQCRC1P31930 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UQCRC1P31930 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UQCRC1P31930 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UQCRC1P31930 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UQCRC1P31930 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UQCRC1P31930 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UQCRC1P31930 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UQCRC1P31930 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UQCRC1P31930 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UQCRC1P31930 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UQCRC1P31930 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UQCRC1P31930 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UQCRC1P31930 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UQCRC1P31930 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UQCRC1P31930 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UQCRC1P31930 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UQCRC1P31930 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UQCRC1P31930 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UQCRC1P31930 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UQCRC1P31930 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UQCRC1P31930 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UQCRC1P31930 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UQCRC1P31930 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UQCRC1P31930 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UQCRC1P31930 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UQCRC1P31930 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UQCRC1P31930 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UQCRC1P31930 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UQCRC1P31930 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UQCRC1P31930 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UQCRC1P31930 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UQCRC1P31930 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UQCRC1P31930 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UQCRC1P31930 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UQCRC1P31930 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UQCRC1P31930 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UQCRC1P31930 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UQCRC1P31930 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UQCRC1P31930 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UQCRC1P31930 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UQCRC1P31930 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UQCRC1P31930 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UQCRC1P31930 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UQCRC1P31930 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UQCRC1P31930 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UQCRC1P31930 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UQCRC1P31930 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UQCRC1P31930 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UQCRC1P31930 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UQCRC1P31930 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UQCRC1P31930 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UQCRC1P31930 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UQCRC1P31930 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UQCRC1P31930 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UQCRC1P31930 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UQCRC1P31930 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UQCRC1P31930 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UQCRC1P31930 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UQCRC1P31930 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UQCRC1P31930 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UQCRC1P31930 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UQCRC1P31930 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UQCRC1P31930 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UQCRC1P31930 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UQCRC1P31930 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UQCRC1P31930 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms