Protein–RNA interactions for Protein: P30825

SLC7A1, High affinity cationic amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A1P30825 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC7A1P30825 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC7A1P30825 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC7A1P30825 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC7A1P30825 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC7A1P30825 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC7A1P30825 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC7A1P30825 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC7A1P30825 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC7A1P30825 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC7A1P30825 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC7A1P30825 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC7A1P30825 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC7A1P30825 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC7A1P30825 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC7A1P30825 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC7A1P30825 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC7A1P30825 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC7A1P30825 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC7A1P30825 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC7A1P30825 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC7A1P30825 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC7A1P30825 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC7A1P30825 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC7A1P30825 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC7A1P30825 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC7A1P30825 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC7A1P30825 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC7A1P30825 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC7A1P30825 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC7A1P30825 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC7A1P30825 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC7A1P30825 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC7A1P30825 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC7A1P30825 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC7A1P30825 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC7A1P30825 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC7A1P30825 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC7A1P30825 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC7A1P30825 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC7A1P30825 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC7A1P30825 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC7A1P30825 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC7A1P30825 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC7A1P30825 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC7A1P30825 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC7A1P30825 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC7A1P30825 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC7A1P30825 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC7A1P30825 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC7A1P30825 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC7A1P30825 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC7A1P30825 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC7A1P30825 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC7A1P30825 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC7A1P30825 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC7A1P30825 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC7A1P30825 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC7A1P30825 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC7A1P30825 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC7A1P30825 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC7A1P30825 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC7A1P30825 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC7A1P30825 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC7A1P30825 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC7A1P30825 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC7A1P30825 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC7A1P30825 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC7A1P30825 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC7A1P30825 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC7A1P30825 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC7A1P30825 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC7A1P30825 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC7A1P30825 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC7A1P30825 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC7A1P30825 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC7A1P30825 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC7A1P30825 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC7A1P30825 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC7A1P30825 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC7A1P30825 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC7A1P30825 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC7A1P30825 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC7A1P30825 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC7A1P30825 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC7A1P30825 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC7A1P30825 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC7A1P30825 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC7A1P30825 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC7A1P30825 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC7A1P30825 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC7A1P30825 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC7A1P30825 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC7A1P30825 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC7A1P30825 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC7A1P30825 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC7A1P30825 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC7A1P30825 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC7A1P30825 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC7A1P30825 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms