Protein–RNA interactions for Protein: P28335

HTR2C, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2CP28335 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR2CP28335 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR2CP28335 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR2CP28335 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR2CP28335 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR2CP28335 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR2CP28335 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR2CP28335 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR2CP28335 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR2CP28335 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR2CP28335 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR2CP28335 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR2CP28335 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR2CP28335 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR2CP28335 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR2CP28335 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR2CP28335 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR2CP28335 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR2CP28335 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR2CP28335 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR2CP28335 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR2CP28335 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR2CP28335 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR2CP28335 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR2CP28335 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR2CP28335 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR2CP28335 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR2CP28335 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR2CP28335 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR2CP28335 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR2CP28335 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR2CP28335 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR2CP28335 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR2CP28335 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR2CP28335 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR2CP28335 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR2CP28335 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR2CP28335 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR2CP28335 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR2CP28335 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR2CP28335 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HTR2CP28335 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR2CP28335 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR2CP28335 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR2CP28335 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR2CP28335 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HTR2CP28335 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HTR2CP28335 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR2CP28335 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR2CP28335 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR2CP28335 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR2CP28335 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR2CP28335 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR2CP28335 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR2CP28335 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR2CP28335 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR2CP28335 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR2CP28335 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR2CP28335 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR2CP28335 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR2CP28335 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR2CP28335 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR2CP28335 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR2CP28335 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR2CP28335 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR2CP28335 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR2CP28335 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR2CP28335 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR2CP28335 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR2CP28335 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR2CP28335 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR2CP28335 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR2CP28335 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR2CP28335 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR2CP28335 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR2CP28335 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR2CP28335 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR2CP28335 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR2CP28335 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR2CP28335 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR2CP28335 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR2CP28335 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR2CP28335 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR2CP28335 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTR2CP28335 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTR2CP28335 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTR2CP28335 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTR2CP28335 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTR2CP28335 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTR2CP28335 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTR2CP28335 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTR2CP28335 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTR2CP28335 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTR2CP28335 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HTR2CP28335 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTR2CP28335 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTR2CP28335 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTR2CP28335 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTR2CP28335 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTR2CP28335 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms