Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMA3P25788 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMA3P25788 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMA3P25788 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMA3P25788 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMA3P25788 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMA3P25788 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMA3P25788 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMA3P25788 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMA3P25788 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMA3P25788 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMA3P25788 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMA3P25788 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSMA3P25788 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSMA3P25788 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSMA3P25788 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PSMA3P25788 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMA3P25788 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMA3P25788 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMA3P25788 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMA3P25788 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMA3P25788 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMA3P25788 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMA3P25788 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMA3P25788 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMA3P25788 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMA3P25788 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMA3P25788 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMA3P25788 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMA3P25788 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMA3P25788 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMA3P25788 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMA3P25788 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMA3P25788 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMA3P25788 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PSMA3P25788 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMA3P25788 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMA3P25788 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMA3P25788 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMA3P25788 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMA3P25788 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMA3P25788 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMA3P25788 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMA3P25788 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMA3P25788 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMA3P25788 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMA3P25788 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMA3P25788 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMA3P25788 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMA3P25788 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMA3P25788 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMA3P25788 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMA3P25788 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMA3P25788 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMA3P25788 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMA3P25788 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMA3P25788 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMA3P25788 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMA3P25788 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMA3P25788 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSMA3P25788 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMA3P25788 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMA3P25788 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMA3P25788 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMA3P25788 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.6 ms