Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP5A1P25705 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP5A1P25705 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP5A1P25705 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP5A1P25705 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP5A1P25705 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP5A1P25705 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP5A1P25705 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP5A1P25705 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP5A1P25705 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP5A1P25705 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP5A1P25705 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP5A1P25705 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP5A1P25705 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP5A1P25705 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP5A1P25705 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP5A1P25705 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP5A1P25705 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP5A1P25705 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP5A1P25705 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP5A1P25705 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP5A1P25705 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP5A1P25705 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP5A1P25705 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP5A1P25705 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP5A1P25705 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP5A1P25705 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP5A1P25705 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP5A1P25705 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP5A1P25705 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP5A1P25705 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP5A1P25705 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP5A1P25705 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP5A1P25705 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP5A1P25705 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP5A1P25705 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5A1P25705 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5A1P25705 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP5A1P25705 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP5A1P25705 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP5A1P25705 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP5A1P25705 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP5A1P25705 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP5A1P25705 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP5A1P25705 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP5A1P25705 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP5A1P25705 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP5A1P25705 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP5A1P25705 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP5A1P25705 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP5A1P25705 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP5A1P25705 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP5A1P25705 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP5A1P25705 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP5A1P25705 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP5A1P25705 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP5A1P25705 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP5A1P25705 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP5A1P25705 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP5A1P25705 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP5A1P25705 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms