Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APCP25054 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APCP25054 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APCP25054 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APCP25054 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APCP25054 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APCP25054 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APCP25054 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APCP25054 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APCP25054 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APCP25054 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APCP25054 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
APCP25054 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APCP25054 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APCP25054 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APCP25054 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APCP25054 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APCP25054 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APCP25054 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APCP25054 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APCP25054 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APCP25054 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APCP25054 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APCP25054 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APCP25054 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APCP25054 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APCP25054 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APCP25054 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APCP25054 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APCP25054 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APCP25054 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APCP25054 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APCP25054 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APCP25054 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APCP25054 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APCP25054 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APCP25054 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APCP25054 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APCP25054 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APCP25054 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APCP25054 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APCP25054 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APCP25054 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APCP25054 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APCP25054 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APCP25054 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APCP25054 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APCP25054 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APCP25054 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APCP25054 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APCP25054 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APCP25054 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APCP25054 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APCP25054 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APCP25054 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APCP25054 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APCP25054 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APCP25054 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APCP25054 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APCP25054 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APCP25054 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APCP25054 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APCP25054 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APCP25054 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APCP25054 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APCP25054 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APCP25054 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APCP25054 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APCP25054 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APCP25054 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APCP25054 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APCP25054 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APCP25054 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APCP25054 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APCP25054 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APCP25054 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APCP25054 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APCP25054 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APCP25054 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APCP25054 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APCP25054 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APCP25054 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APCP25054 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APCP25054 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APCP25054 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APCP25054 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APCP25054 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APCP25054 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APCP25054 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APCP25054 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APCP25054 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APCP25054 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APCP25054 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APCP25054 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APCP25054 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APCP25054 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APCP25054 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APCP25054 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APCP25054 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APCP25054 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms