Protein–RNA interactions for Protein: P20340

RAB6A, Ras-related protein Rab-6A, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6AP20340 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6AP20340 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6AP20340 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6AP20340 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6AP20340 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6AP20340 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6AP20340 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB6AP20340 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB6AP20340 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB6AP20340 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB6AP20340 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB6AP20340 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB6AP20340 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB6AP20340 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB6AP20340 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB6AP20340 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6AP20340 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6AP20340 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6AP20340 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6AP20340 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6AP20340 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6AP20340 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6AP20340 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6AP20340 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6AP20340 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6AP20340 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6AP20340 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6AP20340 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6AP20340 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6AP20340 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6AP20340 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6AP20340 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB6AP20340 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB6AP20340 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB6AP20340 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6AP20340 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6AP20340 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6AP20340 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6AP20340 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB6AP20340 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB6AP20340 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6AP20340 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6AP20340 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6AP20340 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6AP20340 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB6AP20340 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB6AP20340 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB6AP20340 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB6AP20340 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB6AP20340 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB6AP20340 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB6AP20340 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB6AP20340 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB6AP20340 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB6AP20340 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB6AP20340 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB6AP20340 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB6AP20340 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB6AP20340 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6AP20340 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6AP20340 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB6AP20340 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB6AP20340 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB6AP20340 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB6AP20340 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB6AP20340 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB6AP20340 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB6AP20340 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB6AP20340 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB6AP20340 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB6AP20340 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB6AP20340 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB6AP20340 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB6AP20340 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB6AP20340 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB6AP20340 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB6AP20340 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB6AP20340 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB6AP20340 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB6AP20340 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB6AP20340 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB6AP20340 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAB6AP20340 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
RAB6AP20340 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB6AP20340 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB6AP20340 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB6AP20340 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB6AP20340 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB6AP20340 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB6AP20340 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB6AP20340 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB6AP20340 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB6AP20340 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB6AP20340 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB6AP20340 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6AP20340 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6AP20340 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6AP20340 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6AP20340 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6AP20340 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms