Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNMA6AP0CW24 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNMA6AP0CW24 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNMA6AP0CW24 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PNMA6AP0CW24 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNMA6AP0CW24 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNMA6AP0CW24 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PNMA6AP0CW24 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNMA6AP0CW24 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNMA6AP0CW24 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNMA6AP0CW24 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA6AP0CW24 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA6AP0CW24 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNMA6AP0CW24 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNMA6AP0CW24 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNMA6AP0CW24 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNMA6AP0CW24 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNMA6AP0CW24 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNMA6AP0CW24 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNMA6AP0CW24 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PNMA6AP0CW24 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PNMA6AP0CW24 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA6AP0CW24 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA6AP0CW24 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA6AP0CW24 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNMA6AP0CW24 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNMA6AP0CW24 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNMA6AP0CW24 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PNMA6AP0CW24 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PNMA6AP0CW24 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PNMA6AP0CW24 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PNMA6AP0CW24 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PNMA6AP0CW24 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PNMA6AP0CW24 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNMA6AP0CW24 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNMA6AP0CW24 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNMA6AP0CW24 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNMA6AP0CW24 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNMA6AP0CW24 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PNMA6AP0CW24 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PNMA6AP0CW24 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PNMA6AP0CW24 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PNMA6AP0CW24 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PNMA6AP0CW24 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PNMA6AP0CW24 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PNMA6AP0CW24 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PNMA6AP0CW24 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PNMA6AP0CW24 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PNMA6AP0CW24 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PNMA6AP0CW24 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PNMA6AP0CW24 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PNMA6AP0CW24 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PNMA6AP0CW24 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PNMA6AP0CW24 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PNMA6AP0CW24 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PNMA6AP0CW24 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PNMA6AP0CW24 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PNMA6AP0CW24 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PNMA6AP0CW24 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PNMA6AP0CW24 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PNMA6AP0CW24 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PNMA6AP0CW24 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PNMA6AP0CW24 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PNMA6AP0CW24 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PNMA6AP0CW24 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PNMA6AP0CW24 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PNMA6AP0CW24 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PNMA6AP0CW24 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PNMA6AP0CW24 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PNMA6AP0CW24 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PNMA6AP0CW24 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PNMA6AP0CW24 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PNMA6AP0CW24 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PNMA6AP0CW24 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PNMA6AP0CW24 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PNMA6AP0CW24 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PNMA6AP0CW24 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PNMA6AP0CW24 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PNMA6AP0CW24 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PNMA6AP0CW24 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PNMA6AP0CW24 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PNMA6AP0CW24 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PNMA6AP0CW24 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PNMA6AP0CW24 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PNMA6AP0CW24 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PNMA6AP0CW24 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PNMA6AP0CW24 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PNMA6AP0CW24 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PNMA6AP0CW24 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PNMA6AP0CW24 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PNMA6AP0CW24 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PNMA6AP0CW24 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PNMA6AP0CW24 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PNMA6AP0CW24 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PNMA6AP0CW24 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PNMA6AP0CW24 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PNMA6AP0CW24 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
PNMA6AP0CW24 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PNMA6AP0CW24 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PNMA6AP0CW24 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms