Protein–RNA interactions for Protein: P09603

CSF1, Macrophage colony-stimulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1P09603 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSF1P09603 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSF1P09603 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSF1P09603 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSF1P09603 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF1P09603 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF1P09603 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSF1P09603 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF1P09603 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF1P09603 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF1P09603 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF1P09603 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF1P09603 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF1P09603 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF1P09603 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF1P09603 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF1P09603 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF1P09603 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF1P09603 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF1P09603 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF1P09603 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CSF1P09603 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CSF1P09603 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CSF1P09603 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF1P09603 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF1P09603 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF1P09603 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF1P09603 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF1P09603 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF1P09603 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSF1P09603 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSF1P09603 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSF1P09603 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSF1P09603 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSF1P09603 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSF1P09603 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSF1P09603 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSF1P09603 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CSF1P09603 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSF1P09603 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSF1P09603 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSF1P09603 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSF1P09603 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSF1P09603 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSF1P09603 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSF1P09603 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSF1P09603 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSF1P09603 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF1P09603 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF1P09603 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF1P09603 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF1P09603 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF1P09603 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF1P09603 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF1P09603 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSF1P09603 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CSF1P09603 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSF1P09603 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSF1P09603 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSF1P09603 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSF1P09603 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSF1P09603 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSF1P09603 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF1P09603 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF1P09603 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF1P09603 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF1P09603 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF1P09603 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSF1P09603 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSF1P09603 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSF1P09603 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSF1P09603 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CSF1P09603 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CSF1P09603 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSF1P09603 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSF1P09603 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSF1P09603 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSF1P09603 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSF1P09603 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSF1P09603 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSF1P09603 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSF1P09603 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSF1P09603 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CSF1P09603 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSF1P09603 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSF1P09603 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSF1P09603 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSF1P09603 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSF1P09603 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSF1P09603 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSF1P09603 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSF1P09603 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSF1P09603 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSF1P09603 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSF1P09603 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSF1P09603 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSF1P09603 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSF1P09603 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSF1P09603 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CSF1P09603 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms