Protein–RNA interactions for Protein: P08247

SYP, Synaptophysin, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPP08247 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYPP08247 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYPP08247 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYPP08247 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYPP08247 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYPP08247 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYPP08247 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYPP08247 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYPP08247 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYPP08247 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYPP08247 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYPP08247 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYPP08247 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYPP08247 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYPP08247 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYPP08247 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYPP08247 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYPP08247 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYPP08247 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYPP08247 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYPP08247 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYPP08247 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYPP08247 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYPP08247 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYPP08247 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYPP08247 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYPP08247 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYPP08247 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYPP08247 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYPP08247 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYPP08247 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SYPP08247 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SYPP08247 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYPP08247 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYPP08247 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYPP08247 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYPP08247 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYPP08247 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SYPP08247 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYPP08247 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SYPP08247 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYPP08247 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYPP08247 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYPP08247 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SYPP08247 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SYPP08247 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SYPP08247 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SYPP08247 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYPP08247 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYPP08247 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYPP08247 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYPP08247 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYPP08247 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SYPP08247 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYPP08247 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYPP08247 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYPP08247 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SYPP08247 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SYPP08247 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYPP08247 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYPP08247 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYPP08247 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYPP08247 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYPP08247 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYPP08247 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYPP08247 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYPP08247 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYPP08247 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYPP08247 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYPP08247 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYPP08247 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYPP08247 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SYPP08247 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYPP08247 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYPP08247 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYPP08247 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYPP08247 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYPP08247 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYPP08247 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYPP08247 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SYPP08247 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYPP08247 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SYPP08247 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYPP08247 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYPP08247 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYPP08247 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYPP08247 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYPP08247 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYPP08247 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYPP08247 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYPP08247 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYPP08247 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYPP08247 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SYPP08247 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYPP08247 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYPP08247 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYPP08247 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYPP08247 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYPP08247 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYPP08247 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.3 ms