Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED1O96006 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED1O96006 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED1O96006 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED1O96006 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED1O96006 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED1O96006 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED1O96006 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED1O96006 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED1O96006 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED1O96006 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED1O96006 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED1O96006 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED1O96006 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED1O96006 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED1O96006 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED1O96006 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ZBED1O96006 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED1O96006 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED1O96006 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED1O96006 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED1O96006 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED1O96006 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED1O96006 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED1O96006 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED1O96006 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED1O96006 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED1O96006 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZBED1O96006 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED1O96006 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED1O96006 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED1O96006 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED1O96006 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ZBED1O96006 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZBED1O96006 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZBED1O96006 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ZBED1O96006 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZBED1O96006 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZBED1O96006 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZBED1O96006 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZBED1O96006 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED1O96006 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED1O96006 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED1O96006 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED1O96006 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED1O96006 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED1O96006 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED1O96006 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED1O96006 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED1O96006 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED1O96006 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED1O96006 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED1O96006 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED1O96006 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED1O96006 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED1O96006 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED1O96006 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZBED1O96006 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZBED1O96006 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZBED1O96006 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZBED1O96006 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED1O96006 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED1O96006 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED1O96006 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZBED1O96006 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZBED1O96006 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ZBED1O96006 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZBED1O96006 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZBED1O96006 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZBED1O96006 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED1O96006 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED1O96006 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED1O96006 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED1O96006 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED1O96006 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED1O96006 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED1O96006 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED1O96006 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED1O96006 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED1O96006 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED1O96006 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED1O96006 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED1O96006 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED1O96006 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED1O96006 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED1O96006 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED1O96006 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED1O96006 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED1O96006 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED1O96006 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED1O96006 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED1O96006 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED1O96006 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED1O96006 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZBED1O96006 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZBED1O96006 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZBED1O96006 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZBED1O96006 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZBED1O96006 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZBED1O96006 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
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