Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
NPHP4O75161 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
NPHP4O75161 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
NPHP4O75161 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
NPHP4O75161 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
NPHP4O75161 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
NPHP4O75161 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
NPHP4O75161 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
NPHP4O75161 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NPHP4O75161 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
NPHP4O75161 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
NPHP4O75161 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
NPHP4O75161 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NPHP4O75161 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NPHP4O75161 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NPHP4O75161 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NPHP4O75161 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
NPHP4O75161 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
NPHP4O75161 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
NPHP4O75161 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
NPHP4O75161 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NPHP4O75161 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
NPHP4O75161 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
NPHP4O75161 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
NPHP4O75161 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
NPHP4O75161 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
NPHP4O75161 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NPHP4O75161 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NPHP4O75161 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
NPHP4O75161 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NPHP4O75161 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
NPHP4O75161 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NPHP4O75161 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
NPHP4O75161 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NPHP4O75161 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
NPHP4O75161 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NPHP4O75161 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
NPHP4O75161 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
NPHP4O75161 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
NPHP4O75161 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
NPHP4O75161 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
NPHP4O75161 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
NPHP4O75161 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
NPHP4O75161 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
NPHP4O75161 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NPHP4O75161 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NPHP4O75161 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NPHP4O75161 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NPHP4O75161 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NPHP4O75161 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NPHP4O75161 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NPHP4O75161 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NPHP4O75161 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NPHP4O75161 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NPHP4O75161 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NPHP4O75161 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NPHP4O75161 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NPHP4O75161 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NPHP4O75161 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NPHP4O75161 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NPHP4O75161 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NPHP4O75161 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
NPHP4O75161 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
NPHP4O75161 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
NPHP4O75161 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
NPHP4O75161 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
NPHP4O75161 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
NPHP4O75161 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NPHP4O75161 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
NPHP4O75161 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
NPHP4O75161 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
NPHP4O75161 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NPHP4O75161 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
NPHP4O75161 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
NPHP4O75161 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
NPHP4O75161 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC37.03■■■■□ 3.52
NPHP4O75161 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NPHP4O75161 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
NPHP4O75161 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
NPHP4O75161 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
NPHP4O75161 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NPHP4O75161 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
NPHP4O75161 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NPHP4O75161 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NPHP4O75161 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NPHP4O75161 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
NPHP4O75161 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
NPHP4O75161 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
NPHP4O75161 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NPHP4O75161 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
NPHP4O75161 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NPHP4O75161 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
NPHP4O75161 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NPHP4O75161 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
NPHP4O75161 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NPHP4O75161 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
NPHP4O75161 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
NPHP4O75161 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
NPHP4O75161 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
NPHP4O75161 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms